肠道菌群研究的不要错过！这个数据库，让你轻松补上实验数据！任何疾病都适用！

Peryton数据库（https://dianalab.e-ce.uth.gr/peryton/）由DIANA Lab于2021年1月发布在Nucleic Acids Res杂志，数据库精选314篇Pubmed收录的肠道微生物与疾病间相关性的高质量文献，覆盖神经退行性疾病、胃肠道疾病、心血管疾病和肿瘤等43种疾病类型，1396种肠道微生物，以及二者之间7900余条相关性信息。Peryton数据库提供疾病与肠道微生物间相关性信息精准检索及其可视化功能，为基于肠道微生物的疾病发病机制及诊疗相关研究提供极大便利。

菜单栏Help部分提供数据库检索及使用指南，大家可以随时查阅。

▌数据库核心功能及操作演示

Association模块

Association模块提供肠道微生物与疾病相关性信息精确检索功能，基本检索参数部分可选择目标微生物和疾病，高级检索参数部分支持以感兴趣的微生物分类等级、实验方法、疾病类型、相对丰度、样本来源及样本量和出版年月等进行检索结果优化。

以检索拟杆菌属和溃疡性结肠炎相关性信息为例，微生物和疾病名称分别选择Bacteroides和Ulcerative Colitis，高级参数默认，点击Submit等待页面刷新。

检索结果提示，与健康人群对照组相比，溃疡性结肠炎患者：粪便中Bacteroides相对丰度增加；肠粘膜中Bacteroides相对丰度减少。检测方法都是16S rDNA测序，提供对应的参考文献PMID。

以第一条为例，点击后下方显示：MESH ID，可查看溃疡性结肠炎疾病介绍；NCBI TaxID，可查看Bacteroides详细介绍。

Visualizations功能

数据库提供三种Visualizations功能，Graph network、Chord diagram和Hierarchy diagram，可按需查看。

点击Graph network，展示不同分类水平的肠道微生物与疾病相关性网络图。ctrl+F进行页面检索感兴趣的微生物分类。以Bacteroides为例，鼠标点击可局部展示与之相关的疾病网络关系。也可以选择感兴趣的多个微生物种类拉出来展示。

点击Chord diagram，展示门水平的肠道菌群与疾病相关性信息和弦图。点击感兴趣的菌门，如Bacteroidetes，可重点展示与之相关的疾病关系，鼠标悬停某个连线查看是哪种疾病与之相关，以及支持该相关性的文献数目。

点击Hierarchy diagram，展示菌群与疾病相关性层次图，双击某个分类等级，如Genus，重点展示Genus水平相关性。

Submit模块

Peryton数据库支持用户提交个人数据，感兴趣的小伙伴可以了解一下。

总结

Peryton数据库提供疾病与肠道微生物间相关性信息精准检索及其可视化功能，为基于肠道微生物的疾病发病机制及诊疗相关研究提供极大便利。

以上就是Peryton数据库全部内容，开发并维护数据库不易，小伙伴们使用时别忘记引用以下文献哦~！

Skoufos G, Kardaras FS, Alexiou A, Kavakiotis I, Lambropoulou A, Kotsira V, Tastsoglou S, Hatzigeorgiou AG. Peryton: a manual collection of experimentally supported microbe-disease associations. Nucleic Acids Res. 2021 Jan 8;49(D1):D1328-D1333. doi: 10.1093/nar/gkaa902. PMID: 33080028; PMCID: PMC7779029.