自2019年底新冠肺炎疫情爆发以来，立刻在全世界范围内形成了大流行。截至目前统计，官方统计有5亿人感染新冠病毒，600多万人死亡。大量实验表明：粪便样本中新冠病毒RNA的阳性率通常落后于呼吸道样本，因此现有的新冠肺炎诊断程序中并没有粪便样本的检测。
目前还没有新冠病毒经由粪便-口腔传染的报道，这就意味着在隔离设施、医院或隔离场所中，通过这种方式传染的可能性较小。但是，潜在的粪便-口腔传播可能会增加旅馆、宿舍、火车、游轮等公共场所种新冠病毒的传播风险。
2022年4月13日Cell Press细胞出版社新推出的医学期刊Med在线发表了来自斯坦福大学医学院的研究文章“Gastrointestinal symptoms and fecal shedding of SARS-CoV-2 RNA suggest prolonged gastrointestinal infection”。该研究发现新冠患者在呼吸道样本中检测不到SARS-CoV-2 RNA的情况下，粪便中仍长期存在病毒RNA达7个月，而粪便中病毒RNA存在与患者的胃肠道症状存在关联。
在这项研究中，研究团队借助于 2020 年 5 月在斯坦福大学启动的测试COVID轻度感染治疗方法的早期临床试验，分析了113名轻至中度新冠患者在新冠确诊后10个月症状的演变，并定期收集粪便样本、呼吸到样本检测新冠病毒RNA。研究人员说，之前的许多研究都集中在重症 COVID-19 患者的病毒样本检测上，这项研究是首次收集轻度至中度 COVID-19 患者的粪便样本中评估病毒 RNA 的存在。
研究人员发现：
  1. 在诊断后的第一周内，有49.2%的受试者检测到粪便SARS-CoV-2 RNA的存在。
  2. 12.7%的受试者在诊断后4个月时继续在粪便中检测到SARS-CoV-2 RNA，但此时他们并没有检测到口咽SARS-CoV-2 RNA。
  3. 3.8%的受试者在诊断后7个月时仍可检测到粪便SARS-CoV-2 RNA，但是诊断4个月及之后所有受试者的口咽部均无法检测到SARS-CoV-2 RNA。
  4. 结合受试者确诊后的症状演变和粪便SARS-CoV-2 RNA的检测情况，研究人员发现：患者的胃肠道症状（腹痛、恶心、呕吐）与粪便中的SARS-CoV-2 RNA的长期存在有关。
COVID-19病毒主要引起呼吸系统疾病，但这项研究表明，在清除肺部的病毒后，新冠病毒可以感染患者的肠道数周乃至于数月。该文作者、斯坦福大学医学和遗传学副教授高级研究员 Ami Bhatt 博士说：“这可以解释为什么一些 COVID 患者会出现腹痛、恶心、呕吐和腹泻等胃肠道症状。”
Bhatt博士很快指出，虽然RNA是冠状病毒的遗传残留物，但并不是真正的活病毒，因此人的粪便不太可能具有传染性。但是她认为，肠道中长期存在的的 SARS-CoV-2病毒确实对新冠患者的疾病转归存在潜在影响。因为发现那些在粪便中检测到 SARS-CoV-2 RNA的患者，即使他们的呼吸道中已经无法检测到 SARS-CoV-2病毒，但他们仍有很大概率出现胃肠道症状。
与此同时，更多研究也在肠道以外的部位发现了难以消散的病毒储存库。有研究团队分析了在44名COVID-19患者尸检时采集的组织，在心脏、眼睛、大脑等许多部位都发现了病毒RNA的存在，甚至在感染后的第230天还能检测到病毒RNA和蛋白。
最后，Bhatt博士指出，这些发现还对通过测试社区废水中的病毒证据来预测新出现的 COVID-19 爆发的公共卫生工作产生了影响。美国国家传染病基金会医学主任William Schaffner博士表示同意：“如果，正如他们所说，大约 4% 的新冠患者在 7 或 8 个月后仍在粪便中排出病毒残留物，这会使社区中新感染人群的评估变得复杂，这是我们必须考虑并开始展望未来的另一件事。”
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