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关键词:STAT3;基金;临床科研
导言:
支持临床科研选题及国自然基金撰写,我们最近在持续就临床科研的热门靶点进行解析。
本次解读“STAT3”相关的研究大数据分析。

1,美国国立卫生研究院基金资助
美国目前专门用于STAT3研究的课题共有4,754项关键词:STAT3)。从2011开始资助的项目数量在260-364项之间,2022年有321项。
(美国国立卫生研究院基金资助的时间分布和项目数量
2,论文质量和增速
到2022年12月4日,STAT3研究领域已经发表了30,640篇PubMed收录的论文。2011年仅有1,259篇论文,2021年3,329篇论文2022年到目前已经发表了5,087篇论文;论文发表数量增速堪比火箭。
STAT3研究成果14.4%发表在9分+期刊,1.9%发表在24分以上期刊。
(STAT3研究发表的期刊分布及时间分布)
3,为什么STAT3研究受到如此多的关注?
(图源:维基百科。By Peter Znamenskiy
STAT3是STATs家族的成员(包括7个家族成员:STAT1、STAT2、STAT3、STAT4、STAT5a、STAT5b、STAT6),是一种转录因子,为白细胞介素-6(IL-6)激活的急性期反应因子 (APRF) 复合物的一个组成部分;可被细胞因子、生长因子受体和非受体样酪氨酸激酶激活;激活的 STAT3 易位进入细胞核并与 DNA 结合,参与细胞增殖、分化和凋亡;在控制炎症、病毒感染、调节抗肿瘤免疫反应中起着重要作用。(PMID: 27185365;PMID:32972405;PMID: 32201498;PMID: 31588227;PMID: 25951043;PMID: 31711994)
(STAT3的结构域结构和信号通路。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7513516/


(STAT3 抗炎反应的机制。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5050093/

(在动脉粥样硬化过程中,STAT3对内皮细胞功能障碍
的影响
,以及与一些STAT3抑制剂的相互作用。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6771242/
(受病毒感染调节的 STAT3 信号通路。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7079998/




STAT3 在肿瘤微环境(TME
)中诱导免疫抑制。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7513516/



(在联合癌症免疫治疗中靶向 STAT3。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7513516/




(STAT3 在自噬调节中的亚细胞定位。

STAT3同时参与抑制自噬+促进自噬的过程,STAT3不同的亚细胞定位模式通过转录或非转录机制影响自噬。

STAT3通过增加自噬负调控因子BCL2、BCL2L1和MCL1的表达来抑制自噬;
胞质STAT3通过与EIF2AK2、FOXO相互作用抑制自噬。
核STAT3执行其调节HIF-1α和BNIP3促自噬功能。

自噬的启动可能增加不同类型癌细胞对抗癌治疗的耐药性
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4509450/


STAT3在一些病毒感染中表现出前病毒功能(例如HBV、HCV、HSV-1、水痘带状疱疹病毒、HCMV、麻疹病毒),而在另一些病毒感染中起抗病毒作用(例如肠道病毒71、SARS病毒、hMPV)
STAT3的异常激活与多种人类肿瘤的进展和不良预后有关(例如乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌、肺癌、胰腺癌、血液肿瘤)
,小分子药物靶向STAT3治疗癌症一直被认为是有前景的抗癌策略,其中
STAT3抑制剂
Napabucasin(BBI608)针对胰腺癌的疗效尤为瞩目。

STAT3研究一直以来都是顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点
为了解目前在STAT3领域的研究进展,我们对发表的论文做了全面解读,以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢STAT3研究,目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。
4, 精选文献思路速览:
EGFR 信号
通过STAT3 介导的转录促进质膜蛋白TSPAN8 的
核转位
以增强
肿瘤进展
[1]
■ circFARP1 使癌症相关的成纤维细胞能够通过 LIF/STAT3 轴促进胰腺癌吉西他滨的耐药性。 [6]
■ MEK 和 STAT3 联合抑制通过富集具有间充质干细胞样特征的癌症相关成纤维细胞来克服胰腺癌的免疫疗法耐药性,从而揭示基质可塑性。 [8]
■ PDGFRβ 通过间变性大细胞淋巴瘤中的 STAT3/STAT5 过度激活促进致癌进展。
[4]

■ STAT3 功能获得性突变通过病理性 NKG2Dhi CD8+ T 细胞失调和积累将
白血
与自身免疫性疾病联系起来。
[2]
■ DYRK1B-
STAT3
通过
损害线粒体
生物能量学驱动
心脏肥大
心力衰竭
[3]
STAT3
介导的 AIM2 DNA 传感器上调将
先天免疫
细胞迁移
联系起来,以促进
上皮肿瘤
发生。
[10]
■ nterleukin-22 调节
溃疡性结肠炎
中的中性粒细胞募集,并与
优特克单抗
治疗耐药相关。
[5]
■ IL-6/STAT3 轴决定了 PNPLA3 介导的对非酒精性脂肪肝的易感性。 [9]
■ 肿瘤细胞中的 IL-6/
STAT3
信号通过
SMG1
诱导限制移码
衍生新抗原
的表达。
[7]
■ T 细胞衍生的白细胞介素 22 在
结肠隐窝的抗菌防御
中的非冗余作用
[11]
TH17 细胞
需要持续的经典
IL-6 受体信号
来保持转录和功能特性
[12]
NOX1
对 TNFα 诱导的肠上皮 ROS 分泌至关重要,并抑制 M 细胞特征
[13]
NOD2
驱动的
克罗恩病
中的髓样基质生态位和 gp130 rescues
[14]

检索数据库:
Medline

检索工具:文献鸟/PubMed检索时间:December 05, 2022检索及分析机构:Healsan Consulting LLC(美国恒祥咨询); Stork(文献鸟)检索词:STAT3*[Title/Abstract]
一,STAT3研究论文大数据分析
STAT3论文发表的
时间和国家分布

全球已经在
STAT3领域发表了30,640篇Medline收录的文献;我们用文献鸟检索最近三年的数据,得到11,219篇,对6,965进行分析。
时间分布
显示,可以看到针对STAT3的研究论文数量,2021年为5,205篇,2022年至今为4,901篇。国家分布
可以看到,

中国发表的研究论文数量为4,446,占55.8%,排在第一位
美国发表的文章数占17.3%
,排在第二位;日本印度和德国分列第三到五位。
(SCI论文的时间和国家分布)



学术机构排名
复旦大学、上海交通大学医学院、中南大学、山东大学、华中科技大学
等所在大学发表的论文最多。

华西医院郑州大学第一附属医院、中山医院、华中科技大学同济医学院附属同济医院、武汉大学人民医院等是发表论文最多的医院。
(全球发表论文的机构排名)


研究热点基因相关疾病
如下图所示,显示JAK2、EGFR、SOCS3、JAK1、MTOR等是STAT3研究中最受关注的位点。
乳腺癌肺癌大肠癌白血病压力应激胃癌等是STAT3研究中最关注的疾病。
STAT3研究也涉及(溃疡性)结肠炎、关节炎、卵巢癌、前列腺癌、胰腺癌、黑色素瘤、结肠癌、类风湿关节炎、银屑病、糖尿病、膀胱癌、哮喘等疾病。
MTOR研究相关的基因和疾病
哪些期刊喜欢STAT3研究?
可以看到发表STAT3相关研究最多的五个杂志是Int J Mol Sci (IF=6.2)、 Front Immunol (IF=8.8)、 Front Pharmacol(IF=6) 、Cancers (Basel) (IF=6.6)、 Front Oncol (IF=5.7)等。
(发表论文的杂志分布)
我们也附上部分期刊的影响因子、分区、从投稿到接受的天数等,对于投稿有非常重要的参考价值。

最有影响力学者
及其关系网。

国际
STAT3
研究论文中

最有影响力的学者。


(学术大咖及其关系网。)

学者影响力
是基于学者在该领域的论文影响因子总分

其中西奈山伊坎医学院Cho, Judy H庆熙大学(韩国)的Ahn, Kwang Seok洛克菲勒大学Ogishi, Masato复旦大学华山医院Qin, Lunxiu迈阿密大学米勒医学院El-Rifai, Wael湖南省人民医院Wu, Xu康奈尔大学Lin, Hening阿拉巴马大学伯明翰分校Weaver, Casey T等在STAT3研究领域最为活跃。

二,STAT3研究领域
的经典论文


除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外(数量+质量),单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。

所以我们通过大数据分析找到高引用论文,即领域内的经典论文。

高影响力的5篇SCI论文依次为
  • Lu X, et al. EGFR signaling promotes nuclear translocation of plasma membrane protein TSPAN8 to enhance tumor progression via STAT3-mediated transcription. Cell Res. 2022 Apr;32(4):359-374. doi: 10.1038/s41422-022-00628-8. Epub 2022 Feb 23. PMID: 35197608; PMCID: PMC8975831.[1]
  • Masle-Farquhar , et al. STAT3 gain-of-function mutations connect leukemia with autoimmune disease by pathological NKG2Dhi CD8+ T cell dysregulation and accumulation. Immunity. 2022 Nov 18:S1074-7613(22)00591-X. doi: 10.1016/j.immuni.2022.11.001. Epub ahead of print. PMID: 36446385.[2]
  • Zhuang L, et al. DYRK1B-STAT3 Drives Cardiac Hypertrophy and Heart Failure by Impairing Mitochondrial Bioenergetics. Circulation. 2022 Mar 15;145(11):829-846. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.121.055727. Epub 2022 Mar 2. PMID: 35235343.[3]
  • Garces de Los Fayos Alonso I, et al. PDGFRβ promotes oncogenic progression via STAT3/STAT5 hyperactivation in anaplastic large cell lymphoma. Mol Cancer. 2022 Aug 31;21(1):172. doi: 10.1186/s12943-022-01640-7. PMID: 36045346; PMCID: PMC9434917.[4]
  • Hu C, et al. circFARP1 enables cancer-associated fibroblasts to promote gemcitabine resistance in pancreatic cancer via the LIF/STAT3 axis. Mol Cancer. 2022 Jan 19;21(1):24. doi: 10.1186/s12943-022-01501-3. PMID: 35045883; PMCID: PMC8767726.[5]
被引用次数最多的5篇论文依次为:
  • Pavlidis P, et al. Interleukin-22 regulates neutrophil recruitment in ulcerative colitis and is associated with resistance to ustekinumab therapy. Nat Commun. 2022 Oct 3;13(1):5820. doi: 10.1038/s41467-022-33331-8. PMID: 36192482; PMCID: PMC9530232.[6]
  • Meraviglia-Crivelli D, et al. IL-6/STAT3 signaling in tumor cells restricts the expression of frameshift-derived neoantigens by SMG1 induction. Mol Cancer. 2022 Nov 28;21(1):211. doi: 10.1186/s12943-022-01679-6. PMID: 36443756.[7]
  • Datta J, et al. Combined MEK and STAT3 Inhibition Uncovers Stromal Plasticity by Enriching for Cancer-Associated Fibroblasts With Mesenchymal Stem Cell-Like Features to Overcome Immunotherapy Resistance in Pancreatic Cancer. Gastroenterology. 2022 Dec;163(6):1593-1612. doi: 10.1053/j.gastro.2022.07.076. Epub 2022 Aug 7. PMID: 35948109.[8]
  • Park J, et al. IL-6/STAT3 axis dictates the PNPLA3-mediated susceptibility to non-alcoholic fatty liver disease. J Hepatol. 2022 Aug 30:S0168-8278(22)03053-7. doi: 10.1016/j.jhep.2022.08.022. Epub ahead of print. PMID: 36049612.[9]
  • Dawson RE, et al. STAT3-mediated upregulation of the AIM2 DNA sensor links innate immunity with cell migration to promote epithelial tumourigenesis. Gut. 2022 Aug;71(8):1515-1531. doi: 10.1136/gutjnl-2020-323916. Epub 2021 Sep 6. PMID: 34489308.[10]

三,如何开启自己的
STAT3研究
除了前面内容,您已经深信不疑的是:STAT3研究很值得做。尤其是研究生选题,可能这是一辈子课题的好起点。
问题是:如何开始呢?
最简单的方法:从模仿,到超越。
A,基础研究:
在研基金
University of Alabama at Birmingham的Weaver, Casey T目前在研的5项课题,专注于新生儿迟发性败血症、肠道粘膜免疫调节、肠道微生物、粘膜免疫调节中的核受体网络相关研究
1) Targeting the Intestinal Mucosa and Microbiome to Prevent Neonatal Late-onset Sepsis
2) Coordination of Innate and Adaptive Immunity in Intestinal Barrier Defense
3) Nuclear Receptor Control of T Cell Function in Discrete Intestinal Microenvironments
4) Nuclear Receptor Networks in Mucosal Immune Regulation
发表的论文
  1. (2022) A nonredundant role for T cell-derived interleukin 22 in antibacterial defense of colonic crypts Immunity[11]
  2. (2020) TH17 cells require ongoing classic IL-6 receptor signaling to retain transcriptional and functional identity Science immunology[12]
B,转化医学:
在研基金
比如Icahn School of Medicine at Mount Sinai的Cho, Judy H目前在研的3项课题,专注于 克罗恩病、溃疡性结肠炎的研究:
1) Precision IBD via genetics and genomics: integrating International and multi-omic datasets, expanding studies in diverse populations, and defining mechanisms of unmet clinical needs in IBD
2) Intestinal single cell analyses and population differences in innate immunity in Crohn's disease drive treatment response and clinical heterogeneity: towards Precision IBD
3) Mount Sinai NYC Genetics Research Center: Multi-omic integration across data-types, cell niches and populations
发表的论文
Cho, Judy H的系列文章:
  1. (2022) NOX1 is essential for TNFα-induced intestinal epithelial ROS secretion and inhibits M cell signatures 
    Gut
    [13]
  2. (2021) A myeloid-stromal niche and gp130 rescue in NOD2-driven Crohn's disease Nature [14]

Hanson解读

通过针对
STAT3论文的大数据分析,我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1)
STAT3研究,目前是医生科学家最好的切入时机。一方面,STAT3的机制已经比较清楚;另一方面,在肿瘤、自身免疫性疾病、感染性疾病等的研究还远远不够

2)针对
STAT3研究,目前发表了30,640篇Medline论文,且论文数量快速增长。且有非常高的比例发表在高质量期刊上。
发文最多期刊是Int J Mol Sci (IF=6.2)、 Front Immunol (IF=8.8)、 Front Pharmacol(IF=6) 、Cancers (Basel) (IF=6.6)、 Front Oncol (IF=5.7)
等。
有14.4%的研究发表在影响因子大于9分的期刊。3STAT3研究领域广泛
,除了肿瘤本身,在代谢疾病、心脑血管病、自身免疫病等领域都有研究。

4
)针对STAT3研究最有影响力的论文
,已经由机制探索、细胞和动物实验,转向临床转化和研发。

5)由于我们的专业知识所限,本
大数据分析可能存在误差;且仅为学术交流用,不用于任何排名或者比较。也期待各位专家点评及提出改进意见。
6)更多研究靶点分析报告,在本公众号主页面下回复“靶点”查看;如回复“肿瘤科”或“外泌体”,获得对应研究领域推送资料。

既往相关推文:

编辑:Henry,微信号:Healsan
作者简介:美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于医学生物大数据分析临床科研设计和SCI论文深度润色;并提供上述服务,包括针对您课题的大数据分析
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