▲ 超开心!!“Surveillance,Epidemiology, and End Results,SEER”这项基于人群的数据库更新啦!
▲ 上期的《这个看似简单的公共数据库,藏着你不知道的秘密》已为大家介绍了该数据库中人口学、临床病理、生存相关的变量。本期将和大家分享一下SEER数据库的特殊变量。
▲ 在2022年更新的数据库中,增加了一大类,即Site-Specific Data Items,里面包含了脑肿瘤相关的分子病理(适用于2018年及之后的病例);AFP(适用于2010年及之后的病例),让我们一起来看看把!
 脑肿瘤:特殊变量有脑肿瘤分子病理指标
Brain Molecular Markers(2018+)】:该变量适用于2018年及以后诊断的脑肿瘤病例。
蓝色箭头的代表Patient ID为36709521的额叶占位患者,诊断年份为2018年,ICD-O-3组织学诊断为胶质母细胞瘤,脑肿瘤分子病理为:IDH野生型。
蓝色箭头不同,黄色箭头代表Patient ID为36709796的额叶占位患者,ICD-O-3组织学诊断为少突胶质细胞瘤,由于诊断年份为2017,无法获得脑肿瘤分子病理结果。
【Chromosome 1p:Loss of Heterozygosity(LOH)Recode (2010+)】和【Chromosome 19q:Loss of Heterozygosity(LOH)Recode(2010+)】:代表染色体1p和19q缺失状态,适用于2010年及之后的病例。
绿色箭头的代表Patient ID为05558897的脑干占位患者,诊断年份为2008年,ICD-O-3组织学诊断为胶质瘤,无法获得染色体1p和19q缺失状态的信息。
绿色箭头不同,红色箭头代表Patient ID为05559078的额叶占位患者,ICD-O-3组织学诊断为少突胶质细胞瘤,由于诊断年份为2019,分子病理中:染色体1p和19q均缺失。
肝脏肿瘤:特殊变量有AFP和肝纤维化Ishak评分。
【AFP Pretreatment Interpretation Recode (2010+)】:治疗之前AFP水平,适用于2010年及之后的病例。
黄色箭头代表Patient ID为00122031的肝细胞癌患者,诊断年份为2002年,无治疗前AFP信息。
黄色箭头不同,蓝色箭头的代表Patient ID为00152597的肝细胞癌患者,诊断年份为2012年,治疗前AFP为阳性。
【Fibrosis Score Recode (2010+)】:肝纤维化Ishak评分,适用于2010年及之后的病例。
绿色箭头的代表Patient ID为00161739的肝细胞癌患者,诊断年份为2011年,肝纤维化Ishak评分5-6,肝硬化。
绿色箭头不同,红色箭头代表Patient ID为00165179的肝细胞癌患者,诊断年份为2007年,无肝纤维化Ishak评分数据。
前列腺肿瘤:特殊变量有PSA水平,Gleason Patterns 和Gleason Score。
【PSA Lab Value Recode (2010+)】
【Gleason Patterns Clinical Recode (2010+)】
【Gleason Pattens Pathological Recode (2010+)】
【Gleason Score Clinical Recode (2010+)】
【Gleason Score Pathological Recode (2010+]】
肿瘤标志物
【PSA Lab Value Recode (2010+)】
【AFP Pretreatment Interpretation Recode (2010+)】
【CA-125 Pretreatment Interpretation Recode (2010+)】
【CEA Pretreatment Interpretation Recode (2010+]】
除了通过Site-Specific Data Items这个一大类进行特殊变量的查询,对于2004年至2017年间的病例还可以通过 CS Site-Specific Factor 进行查询,具体内容可参考:https://seer.cancer.gov/seerstat/databases/ssf/,此外还可以通过网页下载CS Manual Online Help这个系统进行查询。
比如在卵巢肿瘤中,CS Site-Specific Factor-2代表的是FIGO Stage。
最后,温馨提示:
特殊变量与病种的部位密切相关,小伙伴在应用的时候,记得要确定研究的部位后在进行筛选!
END
撰文丨布涵棠
审核Epione老师
责编丨小张老师
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