BA.2.86产生30多个新突变，现有抗新冠病毒药还有效吗？

BA.2.86变异株高度突变，被列为“监测中的变异株”

2023 年 8 月 17 日，世卫组织将一种新的 SARS-CoV-2 变异株命名为 BA.2.86，由于BA.2.86携带大量（大于30个）基因突变，因此将其定为"监测中的变异株"（VUM，Variants Under Monitoring）。

@shay_fleishon和@LongDesertTrain发现的

BA.2.86（BA.X）尖峰突变谱

来源：X 社交平台

根据世卫组织发布的数据，截至8月17日，BA.2.86的已知序列仅有四个，分别来自欧洲地区的两个国家和美洲地区的一个国家，且没有已知的相关流行病学联系。

SARS-CoV-2 VOIs和VUMs的每周流行率（%）（2023年26-30周）

来源：WHO

BA.2.86 变异的潜在影响目前尚不清楚，世卫组织正在进行仔细评估。随着新冠病毒的不断传播和演变，世卫组织继续呼吁加强对该病毒的监测、测序和报告。

BA.2.86已在4国发现7例，或已出现国际传播

截至8月21日，BA.2.86已在美国、英国、丹麦、以色列4国发现7例感染者。

8月18日，美国疾病控制与预防中心宣布正在追踪BA.2.86。美国密歇根州卫生部就该州发现首例BA.2.86变异株感染者发表声明，称患者是一名老年人，"症状轻微"，目前没有住院治疗。

美国密歇根州卫生部就该州发现首例BA.2.86感染者发表声明

来源：美国密歇根州卫生部

英国卫生安全局（HSA）表示，英国已发现该变种，并正在 "评估情况"。英国HSA在其风险评估中表示，病例地理位置分散，没有旅行史，这“表明存在已确定的国际传播”，这种传播可能是最近才发生的。报告补充到，英国可能存在一定程度的社区传播。

丹麦已发现3例BA.2.86确诊病例，丹麦Statens血清研究所(Statens Serum Institut,SSI)高级研究员Morten Rasmussen说：“新冠病毒发生如此显著的变化，并产生30多个新的突变，是不寻常的。我们上一次看到如此大的变化是在奥密克戎出现的时候。”

丹麦发现三例BA.2.86感染病例

来源：丹麦Statens血清研究所

BA.2.86或是奥密克戎毒株BA.2的后代，与BA.2相比具有34个突变

国外多位专家表示，BA.2.86病毒很可能是在一名免疫力低下的长期感染者体内产生的。这种长期感染使病毒有机会反复进化并收集大量变异——这很可能就是德尔塔和奥密克戎毒株的产生原因。

以色列卫生部的新冠变异株追踪者Shay Fleishon表示，由于受感染的以色列病人免疫力并不低下，这说明这种变异株很可能已经从免疫力低下的人身上转移到了免疫力正常的宿主身上。

根据对GISAID公布的序列分析，福瑞德·哈金森癌症研究中心的进化生物学家Jesse Bloom认为，BA.2.86似乎是奥密克戎毒株BA.2 的后代。BA.2于2022年初传播，而目前的新冠变异株多由奥密克戎毒株XBB进化而来。

BA.2.86 有大量突变，尤其是尖峰处的氨基酸替换。这种模式是在人类慢性感染的抗体压力下进化而来的病毒特征，其中最突出的例子就是奥密克戎。

BA.2.86 新变异株的背景情况

来源：Jesse Bloom

相对于 BA.2（BA.2.86推定祖先），BA.2.86具有34 个突变。

相对于 XBB.1.5（推荐用于疫苗的菌株），BA.2.86具有 36 个突变。

相对于早期武汉-Hu-1 ，BA.2.86具有 58 个突变。

相对于 BA.2 和 XBB.1.5 变异株，BA.2.86 变异株的尖峰氨基酸突变数量，与最早的奥密克戎变异株相对于武汉-Hu-1变异株的突变数量相当。

BA.2.86有大量尖峰氨基酸突变

来源：Jesse Bloom

BA.2.86 传播速度可能更快，免疫逃逸能力可能更强

英国卫生监督局在8月18日的报告中表示，BA.2.86中的大量突变预示着免疫逃逸发生了重大变化。

美国计算生物学家、新冠变异株顶级追踪专家Jesse Bloom表示，BA.2.86具有30个或更多突变，可以将其与其他奥密克戎变异株区分开来，有可能使其更具免疫逃逸性，更容易感染细胞。

在丹麦发现BA.2.86第二例和第三例确诊病例的新冠变异株顶级追踪者Ryan Hisner接受媒体采访时表示，这些病例的广泛传播和显著相似性表明，增长可能很快。

但约翰·霍普金斯大学医学系负责数据完整性和分析的医学副主席Stuart Ray博士指出，尽管这种高度变异的变种与其他已知的流行毒株“非常不同”，但“尚不清楚它是否会对重症病例数量或我们的管理/预防策略产生重大影响”，即使BA.2.86确实迅速传播，也可能不会导致住院人数和死亡人数上升。

现有抗新冠病毒药对BA.2.86仍有效

美国新冠变异株顶级追踪专家Raj Rajnarayanan认为，无论疫苗的抗击效果如何，像抗新冠病毒药物 Paxlovid 这样不针对病毒高度变异的S蛋白的治疗方法，应该仍然会有很好的效果。

当前的抗新冠病毒药主要针对3CLpro（3CL蛋白酶）和RdRp（RNA依赖的RNA聚合酶）两个靶点。其中3CL蛋白酶抑制剂为国际主流抗新冠病毒药物。

新冠病毒复制过程中产生的前体蛋白，需要在3CL蛋白酶作用下拆装再重组，以产生对病毒生存、繁殖非常重要的结构蛋白。而3CL蛋白酶抑制剂可以抑制3CL蛋白酶的活性，从而干扰病毒复制过程，达到抗病毒效果。

3CLpro 抑制剂的功能示意图

来源：文献资料

由于3CL蛋白酶在病毒复制过程中不可或缺，抑制了3CL，就等于扼住了所有新冠病毒变异株的“咽喉”，从源头上让病毒失去了感染正常细胞和扩散的能力，是真正意义上以病毒为目标的靶向治疗。

3CL位点高度保守，不易受病毒突变影响，具有广谱抗冠状病毒活性。目前未见BA.2.86具有3CL蛋白酶突变表现，因此，Paxlovid、先诺欣等3CL蛋白酶抑制剂类抗新冠病毒药物，对BA.2.86仍有效。

参考资料：

[1] ERIN PRATERH. 2023.8.19. Highly mutated COVID variant BA.2.86 has been detected in the U.S. Why the CDC and WHO are monitoring it. FORTUNE WELL.https://fortune.com/well/2023/08/18/ba286-bax-highly-mutated-covid-omicron-strain-detected-united-states-pirola-pi-rho-world-health-organization