科研背景
比较基因组学(Comparative Genomics)利用模式生物基因组与人类基因组之间编码顺序上和结构上的同源性，克隆人类疾病基因，揭示基因功能和疾病分子机制，阐明物种进化关系，及基因组的内在结构。比较不同物种的整个基因组,增强对各个基因组功能及发育相关性的认识。比较不同物种的整个基因组,增强对各个基因组功能及发育相关性的认识。比较基因组学分析已成为生物学尤其是遗传学相关研究的重要手段。通过对生物基因组上遗传信息的挖掘与研究能够促进对不同生物具有的生物学形状下的遗传机制差异、性状演化历史等生物学问题进行深入的了解与研究。
      由于学习平台文献、视频教程资料较少，技术不公开，对于有相应科研任务和发高质量文章的科研人员极度困扰，而培训学习迫在眉睫， 应广大科研人员要求，本单位经过数月调研，决定联合专家共同举办“机器学习单细胞分析+单细胞空间转录组+深度学习基因组学+比较基因组学”专题培训班，本单位已经举办十一期培训，参会人员高达1200余人，对于培训安排和培训质量一致评价极高 ！将内容全部学懂、学会、学透彻、学以致用，完成科研任务和高质量文章！
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培训目标
二、  适于对深度学习、基因组学、转录组学、蛋白组学、药物基因组学等多组学分析感兴趣的学员。课程通过基础入门+应用案例实操演练的方式，从初学及应用研究的角度出发，带大家实战演练多种深度学习模型（深度神经网络DNN、卷积神经网络CNN、循环神经网络RNN、可变自动编码器VAE、图卷积神经网络GCN）通过对这些深度学习在基因组学中的应用案例进行深度讲解和实操，让学员能够掌握深度学习分析高维基因组学、转录组学、蛋白组学等多组学数据流程，系统学习深度学习及基因组学理论知识及熟悉软件代码实操，熟练掌握这些前沿的分析工具的使用以及研究创新深度学习算法解决生物学及临床疾病问题与需求。
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授课专家
主讲老师来自中山大学海洋生物学博士三亚市引进人才，近6年来主要从事动植物基因组、转录组和重测序相关的分析研究工作，尤其关注鱼类适应性演化相关研究。已在Science of The Total Environment、Fish andShellfish lmmunology、BMC genomics等专业期刊发表论文10余篇。
课程一、比较基因组学应用专题线上培训班
第一天（背景知识)
二代基因组测序技术原理 
三代基因组测序技术原理
Hi-C 技术测序技术原理 
基因组测序策略 
基因组的评估标准 
基因组学的研究进展 
比较基因组学的概念与分析方法 
常用数据库的介绍与使用
Linux 操作系统介绍 Linux 常用命令
第二天
第二天 （基因组组装与注释)
基因组 Survey 分析 
基因组的 de novo 组装 
Hi-C 数据挂载、染色体级别基因组的组装 
基因组组装结果的评估 
重复序列注释 
基因组结构注释之同源注释法 
基因组结构注释之从头注释法 
基因组结构注释之 RNA-seq 法 
ncRNA 注释 
基因组功能注释
第三天
第三天(比较基因组学分析)
基因组数据的准备
蛋白序列比对 
基因家族聚类 Single-copy tree的构建 
物种分歧时间 
基因家族扩张/收缩分析 
基因家族的富集分析 
串联法构建全基因组树
第四天
第四天（比较基因组学分析）
ASTRAL分析
Densitree基因多序列比对
正选择分析 
基因组共线性分析
Circos plot的绘制
SNP calling 
SV的检测与注释 
CNV的检测与注释 
PAV的检测与注释
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部分案例图片
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引用往期参会学员的一句话：
发现真的是脚踏实地的同时  需要偶尔仰望星空
          非常感谢各位对我们培训的认可！  祝愿各位学业事业有成！
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