2012年9月5日，《自然》期刊发表了“DNA元件百科全书计划”第二阶段的成果。同期的研究结果被整理为30篇论文并同时发表于多个刊物，包括6篇论文在《自然》、6篇论文在《基因组生物学》及18篇论文在《基因组研究》上。
“DNA元件百科全书计划”（Encyclopedia of DNA Elements， ENCODE），目标是找出人类基因的功能组件。它由美国国家人类基因组研究所（NHGRI）于2003年启动，经历了试验阶段和生产阶段。2020年7月29日，《自然》10篇、《自然方法》1篇、《自然通讯》（3篇）和《生物预印本》（bioRxiv）1篇，共计发表15篇文章，对项目第三个阶段成果进行系统性总结。
项目的第二阶段“生产阶段”于2007年9月开始拨款，并发展成为了一个真正的全球性项目，涉及来自世界各地的32个实验室的440名科学家。
“生产阶段”结果中最引人注目也受到最多争议的是，人类DNA中，有生物活性的比例比以前估计的大，比最乐观的估计还要大得多。9月5日发表在《自然》期刊的综述中表示，80%以上的基因组都有生物化学功能，而非像之前认为的仅仅是“垃圾”。
https://doi.org/10.1038/nature11247
资料来源：

https://zh.wikipedia.org/wiki/ENCODE
https://en.wikipedia.org/wiki/ENCODE
https://zhuanlan.zhihu.com/p/165394569
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