Bringing medical advances from the lab to the clinic.
（只要有SCI论文，就可以全家获得美国绿卡）
关键词：自噬；基金；临床科研
导言：
为辅助课题选题及国自然基金撰写，熟悉最新研究热点和进展；尤其是协助找到最新的课题，我们最近在持续就临床科研的热门靶点进行解析。
本次解读“自噬（autophagy）”相关的研究大数据分析。
1，论文质量和增速
到2022年10月23日，自噬研究领域已经发表了33,156篇PubMed收录的论文。2011年仅有1051篇论文，2022年到目前已经发表了3,575篇论文；论文发表数量增速堪比火箭。

自噬研究成果19.4%发表在9分+期刊，2.0%发表在24分以上期刊；并且最近几年的论文发表数量增速非常快；2021年的发文量达到了2012年的4倍。
(自噬研究发表的期刊分布及时间分布）
2，美国国立卫生研究院基金资助
美国目前专门用于自噬研究的课题达10,656项。从2011的452项，一直到2021年的1097项；且最近四年均保持在每年1000项以上的资助数量。
(美国国立卫生研究院基金资助的时间分布和项目数量）
3，自噬（autophagy）概述
自噬（autophagy）是广泛存在于机体的生理、病理过程的现象，从自噬产生的功能的角度，大致可分为两类。（PMID: 33053285， PMID: 29686264， PMID: 28467923)

*产生降解物质
；主要涉及营养物质的生产，在营养缺乏、生长需求增加时维持细胞存活，让人体适应饥饿/营养受限急性期（如短期饥饿、产后和胚胎着床前期 ）；

*缺陷大分子、细胞器的细胞内清除，对细胞的长寿、组织的发育和分化很重要，主要包括两种情况：细胞内基础水平的固有存在的自噬（例如，神经元中的管家功能），和依赖于溶酶体活性的、选择性靶标药物诱导的自噬（靶标如受损细胞器、入侵细菌——线粒体自噬、铁蛋白自噬、内质网自噬、细菌/异体自噬）。
（
自噬研究的简要时间线。

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29686264/）
自噬相关的疾病主要有三大类：退行性疾病、癌症、自身免疫性疾病。
* 退行性疾病：
包括退行性神经疾病（
如帕金森、佩吉特骨病、肌病、ALS、阿尔茨海默病、亨廷顿病
）和退行性肝病；此时
常见的机制之一是，神经元细胞
、肝细胞中的
ATG基因特异性缺失，异常蛋白质、异常细胞器积累，导致相应组织退化。
*癌症：
包括乳腺癌、胰腺癌、胶质母细胞瘤、多发性骨髓瘤、黑色素瘤等，在不同肿瘤的不同情况中，自噬对疾病的影响机制各不相同。

*自身免疫性疾病：包括
克罗恩病、SLE、肾小球肾炎；
此时常见的机制之一是，
自噬异常引起巨噬细胞释放促炎细胞因子增加，潘氏细胞颗粒分泌减少，沙门氏菌感染易感性增加，T细胞免疫失调。


（自噬的三种膜动力学。

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29686264/）

（自噬调节可能起作用的临床场景。

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33053285/）
2016年自噬现象的发现获诺贝尔生理学奖，无疑是对自噬现象的里程碑式的重大意义的肯定；然而，自噬调节治疗的主要难点之一是，尽管已经明确了不少有疗效的药物，但这些药物并不是针对自噬本身这一过程的，因此，尚有广阔的蓝海亟待开发，为多个热门研究领域的突破性技术的下一个发展方向；更是一直以来都是顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点。
为了解目前在自噬领域的研究进展，我们对发表的论文做了全面解读，以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢自噬研究，目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。
精选文献思路速览：
■ 针对
癌症
中的自噬：癌症发现的最新进展和未来方向
[18]
■ 自噬在
肿瘤转移
中的多效性作用
[16]
■
肿瘤免疫治疗
中的自噬、铁死亡、焦亡和坏死性凋亡。
[9]
■ circROBO1/KLF5/FUS反馈回路通过抑制afadin的选择性自噬调节
乳腺癌肝转移。[1]
■ NUPR1通过激活TFE3依赖性自噬促进口腔鳞状细胞癌细胞的增殖和转移。[2]
■ 在
胰腺癌
中，IGF1R 和 MAPK/ERK 双重抑制增强了对自噬抑制的敏感性自噬
[10]
■ 同时抑制 IGF1R 和 ERK 增加
胰腺癌
对自噬抑制剂的敏感性
[11]
■ 通过自噬抑制、MEK 阻断和 CD40 激动激活
胰腺导管腺癌
的免疫识别。
[3]
■ 基质成纤维细胞中的自噬促进
肿瘤结缔组织
形成和
乳腺肿瘤
发生
[13]
■
胶质母细胞瘤中的癌细胞自噬、重编程巨噬细胞和重构的脉管系统触发肿瘤免疫。 [4]
■ METTL3 介导的 ATG7 的 m6A 修饰调节自噬-GATA4 轴以促进细胞衰老和骨关节炎进展。[5]
■ 胎儿发育不全的肺中受到自噬的损害，并通过给予羊水干细胞胞外囊泡来挽救。[6]
■ 自噬的无创检测。[7]
■ FGF21 通过TFEB 介导的自噬增强和抗氧化反应减轻肢体缺血/再灌注损伤后的微血管损伤。[8]
■
核糖体分析
揭示了自噬在 mRNA 翻译控制中的功能性作用
[17]
■ 溶酶体抑制期间的分泌性自噬 (SALI) [12]
■ 自噬机制在细胞外囊泡生物发生和分泌中的新作用 [14]
■ NRF2 在抑制自噬时激活巨胞饮作用 [15]
检索数据库：
Medline

检索工具：文献鸟/PubMed检索时间：Octorber 23, 2022检索及分析机构：
Healsan Consulting LLC（美国恒祥咨询）; Stork（文献鸟）

检索词：
autophagy[Title]


一，自噬研究论文大数据分析 自噬论文发表的时间和国家分布
全球已经在自噬领域发表了33,156篇Medline收录的文献；我们用文献鸟检索最近三年的数据
，得到14,907篇，对其中的10,956篇进行分析。

时间分布显示，可以看到针对自噬的研究论文数量，2020年有3,268篇，2021年为4,104篇。国家分布可以看到，中国发表的研究论文数量为6,630篇，占60.5%，位居第一
；

美国发表的文章数占14.4%
，排在第二位
；
日本、意大利和印度分列第三到五位。
（SCI论文的时间和国家分布）


学术机构排名
浙江大学、中南大学、复旦大学、中山大学、四川大学
等所在大学发表的论文最多。

华西医院、武汉大学人民医院、浙江大学第一附属医院、华中科技大学同济医学院同济医院、温州医科大学附属第二医院（育英儿童医院）等是发表论文最多的医院。
（全球发表论文的机构排名）

研究热点基因和
相关疾病

如下图所示，显示MTOR、NLRP3、ULK1、SIRT1、STAT3 等是自噬研究中最受关注的基因。
压力应激、乳腺癌、大肠癌、肺癌、胃癌、白血病等是自噬
研究中最关注的疾病。

自噬研究也涉及 胰腺癌、骨关节炎、前列腺癌、黑色素瘤、膀胱癌、卵巢癌、中风、结核、脂肪肝、糖尿病、肝病、脊髓损伤 等疾病。
（自噬研究相关的基因和疾病）
哪些期刊喜欢自噬研究？

可以看到发表自噬相关研究最多的五个杂志是 Autophagy (IF=13.4)、 Int J Mol Sci (IF=6.2)、 Front Pharmacol (IF=6)、 Cell Death Dis (IF=9.7)、 Cells (IF=7.7)等。
（发表论文的杂志分布）
我们也附上部分期刊的影响因子、分区、从投稿到接受的天数等，对于投稿有非常重要的参考价值。
最有影响力学者
及其关系网。


国际
自噬
研究论文中

最有影响力的学者。

（学术大咖及其关系网。）
学者影响力是基于学者在该领域的论文影响因子总分。
其中密歇根大学的Klionsky, Daniel J；东京大学的Mizushima, Noboru；剑桥大学的Rubinsztein, David C；德克萨斯大学西南医学中心的Levine, Beth；巴黎大学的Kroemer, Guido等是自噬研究领域最为活跃的学者。
二，自噬研究领域的经典论文
除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外（数量+质量），单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。

所以我们通过大数据分析找到高引用论文，即领域内的经典论文。
高影响力的SCI论文为：
  • Wang Z, et al. The circROBO1/KLF5/FUS feedback loop regulates the liver metastasis of breast cancer by inhibiting the selective autophagy of afadin. Mol Cancer. 2022 Jan 24;21(1):29. doi: 10.1186/s12943-022-01498-9. PMID: 35073911; PMCID: PMC8785480.[1]
  • Fan T, et al. NUPR1 promotes the proliferation and metastasis of oral squamous cell carcinoma cells by activating TFE3-dependent autophagy. Signal Transduct Target Ther. 2022 Apr 25;7(1):130. doi: 10.1038/s41392-022-00939-7. Erratum in: Signal Transduct Target Ther. 2022 Sep 16;7(1):321. PMID: 35462576; PMCID: PMC9035452.[2]
  • Jiang H, et al. Activating Immune Recognition in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma via Autophagy Inhibition, MEK Blockade, and CD40 Agonism. Gastroenterology. 2022 Feb;162(2):590-603.e14. doi: 10.1053/j.gastro.2021.09.066. Epub 2021 Oct 8. Erratum in: Gastroenterology. 2022 Feb 7;: PMID: 34627860.[3]
  • Chryplewicz , et al. Cancer cell autophagy, reprogrammed macrophages, and remodeled vasculature in glioblastoma triggers tumor immunity. Cancer Cell. 2022 Oct 10;40(10):1111-1127.e9. doi: 10.1016/j.ccell.2022.08.014. Epub 2022 Sep 15. PMID: 36113478; PMCID: PMC9580613.[4]
  • Chen X, et al. METTL3-mediated m6A modification of ATG7 regulates autophagy-GATA4 axis to promote cellular senescence and osteoarthritis progression. Ann Rheum Dis. 2022 Jan;81(1):87-99. doi: 10.1136/annrheumdis-2021-221091. Epub 2021 Oct 27. PMID: 34706873.[5]
被引用次数最多的论文为：
  • Khalaj K, et al. Autophagy Is Impaired in Fetal Hypoplastic Lungs and Rescued by Administration of Amniotic Fluid Stem Cell Extracellular Vesicles. Am J Respir Crit Care Med. 2022 Aug 15;206(4):476-487. doi: 10.1164/rccm.202109-2168OC. PMID: 35671495.[6]
  • Loos B, et al. Non-invasive monitoring of autophagy. Nat Biomed Eng. 2022 Sep;6(9):1015-1016. doi: 10.1038/s41551-022-00943-w. PMID: 36127452.[7]
  • Chen F, et al. FGF21 alleviates microvascular damage following limb ischemia/reperfusion injury by TFEB-mediated autophagy enhancement and anti-oxidative response. Signal Transduct Target Ther. 2022 Oct 12;7(1):349. doi: 10.1038/s41392-022-01172-y. PMID: 36220813; PMCID: PMC9553877.[8]
  • Gao W,et al. Autophagy, ferroptosis, pyroptosis, and necroptosis in tumor immunotherapy. Signal Transduct Target Ther. 2022 Jun 20;7(1):196. doi: 10.1038/s41392-022-010. [9]
三，如何开启自己的自噬研究
除了前面内容，您已经深信不疑的是：自噬
研究很值得做。尤其是研究生选
题，可能这是一辈子课题的好起点。
问题是：如何开始呢？
最简单的方法：从模仿，到超越。
A，基础研究：
在研基金
比如ST. JUDE CHILDREN'S RESEARCH HOSPITAL的Green, Douglas R目前在研的3项课题，专注于细胞死亡的机制研究，包括自噬蛋白的非经典功能：
Non-canonical functions of autophagy proteins

发表的论文

如University of North Carolina at Chapel Hill的Bryant, Kirsten L：
  1. (2022) Susceptibility to autophagy inhibition is enhanced by dual IGF1R and MAPK/ERK inhibition in pancreatic cancer Autophagy [10]
  2. (2022) Concurrent Inhibition of IGF1R and ERK Increases Pancreatic Cancer Sensitivity to Autophagy Inhibitors Cancer research [11]

B，转化医学：
在研基金
如UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO的Debnath, Jayanta目前在研的3项课题，专注于肿瘤细胞中的自噬相关机制，尤其是肿瘤细胞的转移与分化：
1)Autophagy and Pro-metastatic Differentiation

2)Stromal Fibroblast Autophagy In Tumor Progression and Desmoplasia

3)Endolysosomal defects in secretory autophagy and microglial toxicity in FTD
发表的论文
如UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO的Debnath, Jayanta，

  1. (2022) Secretory autophagy during lysosome inhibition (SALI) Autophagy [12]
  2. (2021) Autophagy in stromal fibroblasts promotes tumor desmoplasia and mammary tumorigenesis Genes & development[13]
  3. (2021) Emerging roles for the autophagy machinery in extracellular vesicle biogenesis and secretion FASEB bioAdvances[14]
  4. (2021) NRF2 activates macropinocytosis upon autophagy inhibition Cancer cell[15]
  5. (2021) The pleiotropic functions of autophagy in metastasis Journal of cell science [16]
  6. (2020) Ribosome profiling reveals a functional role for autophagy in mRNA translational control Communications biology [17]
  7. (2019) Targeting Autophagy in Cancer: Recent Advances and Future Directions Cancer discovery [18]
Hanson解读：
通过针对自噬论文的大数据分析，我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。1）自噬研究，目前是医生科学家最好的切入时机。一方面，自噬的机制已经比较清楚；另一方面，目前针对自噬
在不同病理状态下的激活/抑制干预效果研究还远远不够。

2）针对
自噬研究，目前发表了33,156篇Medline论文，且论文数量快速增长。且有非常高的比例发表在高质量期刊上。
发文最多期刊是Autophagy (IF=13.4)、 Int J Mol Sci (IF=6.2)、 Front Pharmacol (IF=6)、 Cell Death Dis (IF=9.7)、 Cells (IF=7.7)
等。
有19.4%的研究发表在影响因子大于9分的期刊,2.0发表在24分以上期刊。
3）自噬研究领域广泛，除了感染、炎症和癌症等先天免疫反应相关疾病以外，在代谢疾病等领域都有研究开展。
4
）针对自噬研究最有影响力的论文，已经由机制探索、细胞和动物实验，转向临床转化和研发。
5）由于我们的专业知识所限，本大数据分析可能存在误差；且仅为学术交流用，不用于任何排名或者比较。也期待各位专家点评及提出改进意见。

6）更多研究靶点分析报告，在本公众号主页面下回复“靶点”查看；如回复“肿瘤科”或“外泌体”，获得对应研究领域推送资料。
既往相关推文：
大数据解析"自噬"：这么追热点最有效！涉及癌症、退行性疾病、自身免疫性疾病、感染等疾病
编辑：Henry，微信号：Healsan。
作者简介：美国Healsan Consulting(恒祥咨询)，专长于医学生物大数据分析、临床科研设计和SCI论文深度润色；并提供上述服务，包括针对您课题的大数据分析。
点击👆，让SCI和基金成为临床工作的副产品！
分析软件及致谢：
感谢“文献鸟”公司VIP项目提供检索和分析。扫描下方二维码，用邮箱注册一个账号，设定关键词，即可每天免费收到新发表论文清单。更多VIP功能咨询，可随时与我们联系。
（扫码👆，注册文献鸟）
医学科研群：
Hanson临床科研目前已有14万+关注，大部分都是医生或生物医学研究者，很多朋友希望我们发起读者群。
我们确实也每天都为已有的群友提供着1）临床科研进展；2）医学英语材料；3）SCI论文一元查重；4）学术交流平台等群福利。
如果您是医生、医学生、生物医学研究者、医学统计师等人员，可以申请加入到读者群。
请加👇Hanson助手，并备注“姓名+科室+单位”。
（入读者群请加👆Hanson助手，并备注“姓名+科室+单位”）
继续阅读
阅读原文
关键词
细胞
论文
疾病
发表论文
自噬研究