大数据解析“内质网应激”丨临床科研热点,由代谢机制研究扩展到多种慢性病程疾病的明星机制
关键词:内质网应激/ER STRESS;基金;临床科研
国自然基金
撰写已至尾声,但群友们追逐最新资讯的热情不减,发来信息,希望解读“
ER STRESS”相关的研究大数据分析。
(ER应激诱导的细胞死亡。https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26587781/)
内质网应激(endoplasmic reticulum stress,ER STRESS),是一种细胞在应激情况下,为避免内质网参与合成的蛋白质结构出现异常(主要表现为未折叠/错误折叠蛋白)、防止异常结构蛋白质在细胞内大量聚集,而出现的一种细胞内保护性应激反应。
ER STRESS在多种细胞死亡、损伤机制中起到关键作用(比如自噬);因此,ER STRESS除了涉及糖尿病、恶性肿瘤等与细胞内代谢紧密相关的病症外,在其它代谢疾病、心脑血管病、多种慢性退行性疾病(包括阿尔兹海默症)、感染、慢性炎症反应相关疾病的病理生理过程中,都起到关键作用。所以,ER STRESS研究一直以来都是顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点
。
ER STRESS研究成果11.2%发表在9分+期刊,1.6%发表在24分以上期刊;并且最近几年的论文发表数量增速堪比火箭。绝对是万众瞩目的热点。
(ER STRESS研究发表的期刊分布及时间分布)
为了解目前在ER STRESS领域的研究进展,我们对发表的论文做了全面解读,以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢ER STRESS研究,目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。
检索数据库:
Medline
检索工具:文献鸟/PubMed检索时间:March 14, 2022检索及分析机构:Healsan Consulting LLC(美国恒祥咨询); Stork(文献鸟)检索词:ER stress[Title] OR endoplasmic reticulum stress[Title]
一,ER STRESS研究论文大数据分析
ER STRESS研究论文发表的
ER STRESS研究论文发表的
时间和国家分布
全球已经在ER STRESS
领域发表了23,634篇Medline收录的文献
;文献鸟则检索到23,607篇,对其中的10,979篇进行分析。
时间分布显示,可以看到针对ER STRESS的研究论文数量,2018年有2,023篇,2021年为2,652篇。国家分布
可以看到,
中国发表的研究论文数量为4,411篇,占40.2%;
美国发表的文章数占25.4%
,排在第二位;
日本
、
印度和意大利分列第三到五位。
(SCI论文的时间和国家分布)
学术机构排名
学术机构排名
中南大学、复旦大学、 首都医科大学、浙江大学、华中科技大学等所在大学发表的论文最多。
武汉大学人民医院、华西医院、中南大学湘雅二医院、华科同济医学院附属同济医院、郑州大学第一附属医院等是发表论文最多的医院。
(全球发表论文的机构排名)
研究热点基因和相关疾病
研究热点基因和相关疾病
如下图所示,显示ATF4、XBP1、MTOR、NLRP3、ATF6等是ER STRESS研究中最受关注的位点。
糖尿病、乳腺癌、肝病、脂肪肝、胰岛素抵抗等是ER STRESS研究中最关注的疾病。
ER STRESS研究也涉及肥胖,大肠癌、肺癌、前列腺癌、黑色素瘤、肾脏疾病,胰腺炎等疾病。
糖尿病、乳腺癌、肝病、脂肪肝、胰岛素抵抗等是ER STRESS研究中最关注的疾病。
ER STRESS研究也涉及肥胖,大肠癌、肺癌、前列腺癌、黑色素瘤、肾脏疾病,胰腺炎等疾病。
(ER STRESS研究相关的基因和疾病)
ER STRESS研究
的关键词
ER STRESS研究
的关键词
包括凋亡、蛋白、癌症、应答和信号通路
等。
哪些期刊喜欢ER STRESS研究?
可以看到发表ER STRESS相关研究最多的五个杂志是Int J Mol Sci (IF=5.9)、 Sci Rep (IF=4.4)、 Cell Death Dis (IF=8.5)、 Biochem Biophys Res Commun (IF=3.6)、 Front Pharmacol (IF=5.8)等。
(发表论文的杂志分布)
这些期刊的影响因子、分区、接受时间等如下所示。
最有影响力学者
及其关系网。
国际
ER STRESS研究论文中
最有影响力的学者。
(学术大咖及其关系网。)
学者影响力是基于学者在该领域的论文影响因子总分。
其中智利大学的Hetz, Claudio
;高丽大学的Song, Gwonhwa;全布克国立大学(韩国)的Chae, Hanjung;剑桥大学的Ron, David;Harvard T.H. Chan School of Public Health的Hotamisligil, Gökhan S;加州大学伯克利分校的Dillin, Andrew;贝勒医学院的Chen, Xi;韩国国民大学的Lim, Whasun;剑桥大学的Marciniak, Stefan J ;Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute的Kaufman, Randal J等在ER STRESS研究领域最为活跃。
二,ERSTRESS研究领域的经典论文
除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外(数量+质量),单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。
所以我们通过大数据分析找到高引用论文,即领域内的经典论文。
从下图可以看出
ER STRESS研究领域论文的爆发,及经典论文的分布。
最受关注的论文,涉及的病症主要为神经退行性变、肾病、非酒精性脂肪肝、(肿瘤)细胞命运、错误折叠蛋白;涉及的研究方法、研究重点包括药理学靶向、 C/EBP 同源蛋白 (CHOP) 转录因子、 BiP、IRE1、 感染、 凋亡、 自噬。这些论文是ER STRESS
研究的经典论文,也是必读和必引论文。
如果我们只看最近发表的重要论文时,可以看到2021、2022年新发表的论文中,既有对疾病的机制研究,也有新药研发、基础医学技术,涉及的病症主要包括药理学靶向、 溶酶体、 机制、 巨噬细胞免疫抑制、 PERK、 QRICH1、肿瘤及其微环境 未折叠蛋白、 蛋白质稳态的转录调控、 胰腺 β细胞等。
三,如何开启自己的ER STRESS研究
除了前面内容,您已经深信不疑的是:ER STRESS
问题是:如何开始呢?最简单的方法:从模仿,到超越。
基础研究学者:
研究很值得做。尤其是研究生选
题,可能这是一辈子课题的好起点。问题是:如何开始呢?最简单的方法:从模仿,到超越。
基础研究学者:
比如智利大学的Hetz, Claudio,
全布克国立大学(韩国)的Chae, Hanjung,和
剑桥大学的Marciniak, Stefan J发表的ER STRESS激活
信号、传导结构、凋亡机制与疾病相关的系列研究论文。
临床科学家:可以参照复旦大学附属中山医院的Kaufman, Randal J,华科同济医院的Wang, Yi疾病与治疗相关的系列研究论文,机制结合临床研究,由浅入深。
如果要做转化,则可以参照浙江大学的临床药学家You, Jian,致力于药物的基础研究开发到临床应用探索。
而最容易的切入点还是经典一套:A因子/蛋白通过B信号通路途径调控了(抑制/增强)ER STRESS从而抑制/增强了C疾病/细胞的D功能。比如这篇文章标题的描述。
或者如NIH资助的基金题目,如下:
小结:
通过针对ER STRESS论文的大数据分析,我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1)ER STRESS研究,目前是医生科学家最好的切入时机。一方面,ER STRESS的机制已经比较清楚;另一方面,目前针对ER STRESS
通过针对ER STRESS论文的大数据分析,我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1)ER STRESS研究,目前是医生科学家最好的切入时机。一方面,ER STRESS的机制已经比较清楚;另一方面,目前针对ER STRESS
在不同类型的糖尿病、及并发症的干预效果研究还远远不够。
2)针对
ER STRESS研究,目前发表了23,634篇Medline论文,且论文数量快速增长。且有非常高的比例发表在高质量期刊上。中国、美国、日本、印度和意大利在ER STRESS研究中处于领先。
3)
ER STRESS研究发文最多期刊是Int J Mol Sci (IF=5.9)、 Sci Rep (IF=4.4)、 Cell Death Dis (IF=8.5)、 Biochem Biophys Res Commun (IF=3.6)、 Front Pharmacol (IF=5.8)等。有11.2%的研究发表在影响因子大于9分的期刊,1.6%发表在24分以上期刊。4)ER STRESS研究领域广泛
,除了
糖尿病、恶性肿瘤等与细胞内代谢紧密
相关的病症外,在其它代谢疾病、心脑血管病、多种慢性退行性疾病(
包括阿尔兹海默症)、感染、慢性炎症反应相关疾病等领域都有研究。
5
)针对ER STRESS研究最有影响力的论文,已经由机制探索、细胞和动物实验,转向临床转化和研发。更多阅读:
编辑:Henry,微信号:Healsan。
Hanson临床科研,由6位在美国的医生及医学科学家组成。
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