Bringing medical advances from the lab to the clinic.
(只要有SCI论文,就能全家移民美国,或回国实现抱负!)
关键词:Hippo信号通路;基金;临床科研
导言:
支持临床科研选题及国自然基金撰写,我们最近在持续就临床科研的热门靶点进行解析。
本次解读“Hippo信号通路”相关的研究大数据分析。

1,美国国立卫生研究院基金资助
美国目前专门用于Hippo信号通路研究的课题共有479项关键词:Hippo)从2011的9项,一直到2022年的60
(美国国立卫生研究院基金资助的时间分布、项目数量资助金额
2,论文质量和增速
到2022年11月5日,Hippo信号通路研究领域已经发表了27,108篇PubMed收录的论文。2011年仅有897篇论文,2021年2,889篇论文2022年到目前已经发表了2,399篇论文。
Hippo信号通路研究成果10.6%发表在9分+期刊,1.6%发表在24分以上期刊。
(Hippo信号通路研究发表的期刊分布及时间分布)
3,为什么Hippo研究受到如此多的关注?
Hippo 信号通路,也称为Salvador / Warts / Hippo(SWH)通路,命名主要源于果蝇中的蛋白激酶Hippo(Hpo),是通路中的关键调控因子。该通路由一系列保守激酶组成,主要通过调控细胞增殖和凋亡从而在器官大小调控、细胞的增殖-分化-衰老、癌症发生、组织再生、以及干细胞的功能上发挥重要作用
Hippo 通路的主要效应分子 YAP( Yes-associated protein)的异常活化与多种肿瘤发生发展密切相关。
Hippo通路的生物学效应有:

*调控器官体积:
Hippo信号通路抑制Wnt信号从而抑制心肌细胞增殖和控制心脏大小。

*调控组织再生:
YAP活性对于正常的组织生长发育及稳态维持不是必需的,但其对组织损伤后的组织再生却具有重要作用。例如,正常的小鼠经受葡聚糖硫酸钠引起的结肠炎后,能够有效再生修复,而条件性敲除YAP的小鼠的再生修复能力明显削弱。

*保持细胞增殖及凋亡平衡:
在高密度条件下,细胞间的紧密连接和粘附连接增多,激活LATS1/2,使YAP被高度磷酸化,YAP滞留在细胞质中,从而抑制YAP下游基因的转录表达,细胞增殖受到抑制;反之,在低密度条件下,Hippo信号通路被抑制,YAP不能与14-3-3结合,而是顺利进入细胞核与TEAD结合,诱导下游基因转录表达,促进细胞增殖。

*参与细胞接触性抑制调节:
接触抑制是当细胞与相邻细胞接触时,贴壁细胞停止增殖的一种现象,它是避免组织过度增长的机制,能够维持机体组织的正常。

(器官大小调控、组织稳态和肿瘤中的Hippo信号通路:

当Hippo信号关闭时,YAP/TAZ进入细胞核,与VGLL4竞争TEAD,并招募其他因子诱导基因转录;YAP/TAZ可以结合靶基因的近端启动子或远端增强子来诱导转录。

当Hippo信号打开时,YAP/TAZ在多个位点被LATS1/2磷酸化,导致与14-3-3的相互作用和细胞质滞留;磷酸化也会导致YAP/TAZ多泛素化和降解;VGLL4与TEAD相互作用并抑制靶基因转录。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4638384/




(低表达Hippo信号诱发Pkd1突变体-常染色体显性遗传多囊肾病(ADPKD)发生。在肾小管上皮细胞中,Pkd1缺乏导致ADPKD;原囊表型由过度活化的YAP/TAZ、及其转录靶标c-Myc的上调介导。

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29921661/



(Hippo 通路激酶 LATS1/2 抑制肿瘤免疫。

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29921661/



(肝癌中靶向 Hippo 信号通路的策略。

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35064256/

Hippo信号通路是肿瘤治疗耐药性(如索拉菲尼、顺铂、紫杉醇)、再生医学研究一直以来的热门切入点是顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点
为了解目前在Hippo信号通路领域的研究进展,我们对发表的论文做了全面解读,以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢Hippo信号通路研究,目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。
4, 精选文献思路速览:
■ lncExACT1 和 DCHS2 调节生理和病理
心脏
生长。
[10]
■ Hippo-Yap 信号维持
窦房结稳态。[6]
■ 先天性心脏病的综合多组学特征。
[3]
肝脏中的Hippo信号:在发育、再生和疾病中的作用。 [1]
■ YAP 通过 TET1 介导的肝脏生长和肿瘤发生中的表观遗传重塑诱导致癌转录程序。[7]
肝脏稳态和病理生理学中的 Hippo 通路 [14]
■ Hippo 通路效应子 YAP 抑制 HIF2 信号传导和
肾透明细胞癌
(ccRCC)生长。
[8]
■ WWTR1(TAZ)-CAMTA1 重新编程内皮细胞以驱动上皮样血管内皮瘤 [13]
■ 细胞外液粘度增强细胞迁移和癌症转移。
[4]
■ Hippo 信号通路及其对人类健康和疾病的影响。
[9]
■ Hippo 信号通路的展开
[12]
■ 发育和疾病中的Hippo 信号通路
[15]
■ 多相聚结介导 Hippo 通路激活 [5]
■ 人类胚泡模型胚泡发育和植入。 [2]
■ Nerfin-1 在细胞竞争中抑制 Hippo 信号的转录输出 [16]
■ 单细胞完整动物 Capsaspora owczarzaki 中的基因组编辑表明 Hippo 途径在多细胞形态发生中的前后生动物作用 [11]
检索数据库:
Medline

检索工具:文献鸟/PubMed检索时间:November 13, 2022检索及分析机构:Healsan Consulting LLC(美国恒祥咨询); Stork(文献鸟)检索词:(Hippo*[Title/Abstract]) AND (pathway*[Title/Abstract])
一,Hippo信号通路研究论文大数据分析
Hippo信号通路论文发表的
时间和国家分布

全球已经在
Hippo信号通路领域发表了27,108篇Medline收录的文献;我们用文献鸟检索最近三年的数据,得到9,154篇,对这些文章进行分析。
时间分布
显示,可以看到针对Hippo信号通路的研究论文数量,2019年有1,975篇,2021年为2,599篇,2022年至今为2,324篇。国家分布
可以看到,

中国发表的研究论文数量为4,197,占45.9%,排在第一位
美国发表的文章数占21.2%
,排在第二位;日本、德国和伊朗分列第三到五位。
(SCI论文的时间和国家分布)



学术机构排名


中南大学、加州大学圣地亚哥分校、浙江大学四川大学华中科技大学同济医学院
等所在大学发表的论文最多。

华西医院、德克萨斯大学西南医学中心、湘雅医院华中科技大学同济医院重庆医科大学第一附属医院等是发表论文最多的医院。
(全球发表论文的机构排名)

研究热点基因相关疾病
如下图所示,显示TAZ、BDNF、YAP1、MTOR、NLRP3 等是Hippo信号通路研究中最受关注的位点。
压力应激、抑郁、癫痫、乳腺癌脑损伤等是Hippo信号通路
研究中最关注的疾病。

Hippo信号通路研究也涉及痴呆、肺癌、大肠癌、中风、精神分裂症、胃癌、糖尿病、焦虑、胰腺癌、前列腺癌、黑色素瘤、自闭症、妊娠、卵巢癌、胆管癌等疾病。
(Hippo信号通路研究相关的基因和疾病)
哪些期刊喜欢Hippo信号通路研究?
可以看到发表Hippo信号通路相关研究最多的五个杂志是Int J Mol Sci (IF=6.2)、 Sci Rep (IF=5) 、 Front Pharmacol (IF=6)、 Mol Neurobiol (IF=5.7) 、 Front Cell Dev Biol (IF=6.1) 等。
(发表论文的杂志分布)
我们也附上部分期刊的影响因子、分区、从投稿到接受的天数等,对于投稿有非常重要的参考价值。
最有影响力学者
及其关系网。

国际
Hippo信号通路
研究论文中

最有影响力的学者。


(学术大咖及其关系网。)

学者影响力
是基于学者在该领域的论文影响因子总分

其中加州大学圣地亚哥分校Guan, Kunliang; 基因泰克公司Dey, Anwesha;University of Leuven(比利时)Moya, Iván M德克萨斯大学西南医学中心Pan, Duojia重庆医科大学第一附属医院Xie, Peng复旦大学附属中山医院Zhou, Zhaocai;南开大学Zhang, TaoUniversity of Leuven(比利时)Halder, Georg等在Hippo信号通路研究领域最为活跃。

二,Hippo信号通路研究领域的经典论文
除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外(数量+质量),单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。

所以我们通过大数据分析找到高引用论文,即领域内的经典论文。

高影响力的5篇SCI论文依次为
  • Russell JO, Camargo FD. Hippo signalling in the liver: role in development, regeneration and disease. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2022 May;19(5):297-312. doi: 10.1038/s41575-021-00571-w. Epub 2022 Jan 21. PMID: 35064256; PMCID: PMC9199961.[1]
  • Kagawa H, et al. Human blastoids model blastocyst development and implantation. Nature. 2022 Jan;601(7894):600-605. doi: 10.1038/s41586-021-04267-8. Epub 2021 Dec 2. PMID: 34856602; PMCID: PMC8791832.[2]
  • Hill MC, et al. Integrated multi-omic characterization of congenital heart disease. Nature. 2022 Aug;608(7921):181-191. doi: 10.1038/s41586-022-04989-3. Epub 2022 Jun 22. PMID: 35732239.[3]
  • Bera K, et al. Extracellular fluid viscosity enhances cell migration and cancer dissemination. Nature. 2022 Nov;611(7935):365-373. doi: 10.1038/s41586-022-05394-6. Epub 2022 Nov 2. PMID: 36323783.[4]
  • Wang L, et al. Multiphase coalescence mediates Hippo pathway activation. Cell. 2022 Nov 10;185(23):4376-4393.e18. doi: 10.1016/j.cell.2022.09.036. Epub 2022 Oct 31. PMID: 36318920.[5]
被引用次数最多的5篇论文依次为:
  • Zheng M, et al. Hippo-Yap Signaling Maintains Sinoatrial Node Homeostasis. Circulation. 2022 Nov 1. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.121.058777. Epub ahead of print. PMID: 36317529..[6]
  • Wu BK, et al. YAP induces an oncogenic transcriptional program through TET1-mediated epigenetic remodeling in liver growth and tumorigenesis. Nat Genet. 2022 Aug;54(8):1202-1213. doi: 10.1038/s41588-022-01119-7. Epub 2022 Jul 14. PMID: 35835915; PMCID: PMC9357225.[7]
  • Li X, et al. The Hippo pathway effector YAP inhibits HIF2 signaling and ccRCC tumor growth. Cell Discov. 2022 Oct 6;8(1):103. doi: 10.1038/s41421-022-00465-4. PMID: 36202785; PMCID: PMC9537283.[8]
  • Fu M, et al. The Hippo signalling pathway and its implications in human health and diseases. Signal Transduct Target Ther. 2022 Nov 8;7(1):376. doi: 10.1038/s41392-022-01191-9. PMID: 36347846; PMCID: PMC9643504.[9]
  • Li H, et al. lncExACT1 and DCHS2 Regulate Physiological and Pathological Cardiac Growth. Circulation. 2022 Apr 19;145(16):1218-1233. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.121.056850. Epub 2022 Feb 4. PMID: 35114812; PMCID: PMC9056949.[10]
三,如何开启自己的Hippo信号通路研究
除了前面内容,您已经深信不疑的是:Hippo信号通路研究很值得做。尤其是研究生选题,可能这是一辈子课题的好起点。
问题是:如何开始呢?
最简单的方法:从模仿,到超越。
A,基础研究:
在研基金
如University of Texas Southwestern Medical Center的Pan, Duojia目前在研的1项课题,专注于肾脏发育的基础研究
Control of Cell Number in Developing Retina

发表的论文

Pan, Duojia的系列文章:
  1. (2022) Multiphase coalescence mediates Hippo pathway activation 
    Cell [5]
  2. (2022) Genome editing in the unicellular holozoan Capsaspora owczarzaki suggests a premetazoan role for the Hippo pathway in multicellular morphogenesis eLife [11]
  3. (2022) The unfolding of the Hippo signaling pathway Developmental biology [12]
  4. (2021) WWTR1(TAZ)-CAMTA1 reprograms endothelial cells to drive epithelioid hemangioendothelioma Genes & development [13]
  5. (2021) The Hippo Pathway in Liver Homeostasis and Pathophysiology Annual review of pathology [14]
  6. (2019) The Hippo Signaling Pathway in Development and Disease Developmental cell [15]
  7. (2019) Nerfin-1 represses transcriptional output of Hippo signaling in cell competition eLife [16]
B,转化医学:
在研基金
比如The University of Texas MD Anderson Cancer Center的Wang, Chao目前在研的3项课题,专注于用纳米粒子技术来解决蛋白质和抗体的定位、定量、定性问题
1) Integrated Nano-Opto-Fluidic System on Sapphire towards Single-Molecule Protein Sequencing
2) High-Throughput, Rapid, and Epitope-Specific Quantification of Neutralizing Antibodies Using Digital Nanoparticle Sensors
发表的论文
Wang, Chao
的系列文章:

  1. (2022) Integrated screens uncover a cell surface tumor suppressor gene KIRREL involved in Hippo pathway Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America [18]
  2. (2020) Microglia mediate forgetting via complement-dependent synaptic elimination Science (New York, N.Y.) [19]

Hanson解读

通过针对
Hippo信号通路论文的大数据分析,我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1)
Hippo信号通路研究,目前是医生科学家最好的切入时机。一方面,Hippo信号通路
的机制已经比较清楚;另一方面,在不同类型的肿瘤、及并发症的干预效果研究还远远不够。

2)针对
Hippo信号通路研究,目前发表了27,108篇Medline论文,且论文数量快速增长。且有非常高的比例发表在高质量期刊上。
发文最多期刊是Int J Mol Sci (IF=6.2)、 Sci Rep (IF=5) 、 Front Pharmacol (IF=6)、 Mol Neurobiol (IF=5.7) 、 Front Cell Dev Biol (IF=6.1)
等。
有10.6%的研究发表在影响因子大于9分的期刊。3Hippo信号通路研究领域广泛
,除了发育再生、
退行性神经疾病、阿尔茨海默症
本身,在代谢疾病、心脑血管病、精神病等领域都有研究。

4
)针对Hippo信号通路研究最有影响力的论文
,已经由机制探索、细胞和动物实验,转向临床转化和研发。

5)由于我们的专业知识所限,本
大数据分析可能存在误差;且仅为学术交流用,不用于任何排名或者比较。也期待各位专家点评及提出改进意见。
6)更多研究靶点分析报告,在本公众号主页面下回复“靶点”查看;如回复“肿瘤科”或“外泌体”,获得对应研究领域推送资料。

既往相关推文:
更多有用的免费资源:
(点击👆图片,进入自己感兴趣的专辑。或获得点击“资源”,浏览本公众号所有资源

编辑:Henry,微信号:Healsan
作者简介:美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于医学生物大数据分析临床科研设计和SCI论文深度润色;并提供上述服务,包括针对您课题的大数据分析
点击👆,让SCI和基金成为临床工作的副产品!
分析软件及致谢:
感谢“文献鸟”公司VIP项目提供检索和分析。扫描下方二维码,用邮箱注册一个账号,设定关键词,即可每天免费收到新发表论文清单。更多VIP功能咨询,可随时与我们联系。
(扫码👆,注册文献鸟)
继续阅读
阅读原文