Bringing medical advances from the lab to the clinic.
关键词：干细胞；基金；临床科研
导言：
为辅助课题选题及国自然基金撰写，熟悉最新研究热点和进展；尤其是协助找到最新的课题，我们最近在持续就临床科研的热门靶点进行解析。
本次解读“干细胞（stem cell）”相关的研究大数据分析。
有些朋友可能会问：

为什么要解读干细胞研究呢？
因为：

干细胞研究终于到了“采果子”的时候。
最近几年，干细胞研究临床转化的趋势日益明显，并在数个领域取得突破。
1，论文质量和增速
到2022年10月24日，干细胞研究领域已经发表了113,337篇PubMed收录的论文。2011年仅有8
,355
篇论文，
2022年发表了9,370篇论文
；论文发表数量增速堪比火箭。

干细胞研究成果15.1%发表在9分+期刊，4.4%发表在24分以上期刊。持续的发文量大、高质量论文多，显示干细胞研究已经出现了新的突破。
(干细胞研究发表的期刊分布及时间分布）
2，美国国立卫生研究院基金资助
美国在干细胞领域的课题，2011-2021这十年一直维持在5000-8500项的高密度资助，2022年到现在也有1,551项。
(美国国立卫生研究院基金资助的时间分布和项目数量
）

3，干细胞（stem cell）研究概述
根据中国《干细胞及转化研究重点专项度项目申报指南（2021年）》的干细胞研究分类：

1）.多能干细胞的建立与干性维持；

2）.组织干细胞的获取、功能和调控；

3）.干细胞定向分化及细胞转分化；

4）.干细胞移植后体内功能成立与调控；

5）.鉴于干细胞和生物资料的组织工程和器官再造；

6）.干细胞资源库；

7）.利用动物模型进行干细胞临床前评估；

8）.干细胞临床研究。

（肿瘤干细胞的分级、转移的转录调控。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34272502/）
（干细胞类型和功能概述。

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34272502/）
常见研究里的干细胞可分为：肿瘤干细胞、间充质干细胞、胚胎干细胞、脂肪干细胞、诱导性多能干细胞等。
上个世纪90年代初，干细胞（stem cell）研究进入高速增长期以来，已在组织工程和器官再造的临床应用领域取得一定进展，其中，除了用于治疗血液系统疾病的骨髓干细胞移植以外，自体干细胞再生进行整形重建手术也已应用于临床数年，并取得良好疗效；此外，干细胞的类器官研究、干细胞与特定功能位点的微环境互作（例如，干细胞分泌因子的调控、免疫细胞对局部干细胞的影响）、肿瘤干细胞的演化机制、干细胞在特定组织器官中（例如神经系统）的再生调控机制等领域的研究尚在临床前阶段，广阔的蓝海亟待开发，为多个热门研究领域的突破性技术的下一个发展方向；更是顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点。（PMID:29402728，PMID:29396297，PMID:34272502）
为了解目前在干细胞领域的研究进展，我们对发表的论文做了全面解读，以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢干细胞研究，目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。
精选文献思路速览：
■ 慢病毒造血干细胞基因治疗
早发性异染性
脑白质营养不良
：非随机、开放标签、1/2 期试验和扩大使用范围的长期结果。（临床试验）
[1]
■ Lisocabtagene maraleucel(CAR-T疗法) 与挽救性化疗后自体干细胞移植作为复发/难治性大 B 细胞淋巴瘤
患者二线治疗的护理标准(TRANSFORM)：开放标签、随机、阶段的中期分析结果3审。（临床试验）
[2]
■ Schimke 免疫骨发育不良的
干细胞-肾移植
。
[4]
■
ALS(肌肉萎缩性侧索硬化症)
的
干细胞-基因联合治疗
策略。
[10]
■ 人类多能干细胞衍生的胰岛可改善非人类灵长类动物的
糖尿病
。
[6]
■ 从多能干细胞生成人体动脉和静脉细胞突出了尼帕病毒和亨德拉
病毒
的动脉嗜性。
[8]
■ 减少血液干细胞移植中的
移植物抗宿主病
。
[5]
■ 可扩展的大孔水凝胶增强干细胞治疗
体积性肌肉损失
[14]

■ Tubastatin A 使成体
骨骼肌干细胞
离体保持静止状态，并提高其在体内的移植能力
[18]
■
淋巴管是调节肠道干细胞活性
的信号枢纽
[12]
■ 迁移维持
肠道干细胞
数量
[11]
■
禁食
通过酮体信号传导在肌肉干细胞中诱导高度弹性的深度静止状态
[16]
■ 干细胞通过积累不同的
表观遗传记忆
来增强效力并改变组织适应性
[13]
■ 组织干细胞及其生态位的
衰老和再生[15]
■ 影响
癌前干细胞
的恶性循环。
[3]
■ 来自大鼠多能干细胞的功能性原始生殖细胞样细胞。
[7]
■ 将人类多能干细胞还原到八细胞胚胎样阶段。
[9]
■ ATR 活性通过细胞周期蛋白 F-SCF 复合物控制干细胞静止
[17]
检索数据库：
Medline

检索工具：文献鸟/PubMed检索时间：Octorber 24, 2022检索及分析机构：
Healsan Consulting LLC（美国恒祥咨询）; Stork（文献鸟）

检索词：
Stem cell*[Title]

一，干细胞研究论文大数据分析 干细胞
研究论文发表

的时间和国家分布

全球已经在干细胞领域发表了162,328篇Medline收录的文献；我们用文献鸟检索最近三年的数据，得到41,811篇，对其中的10,915篇进行分析。
时间分布显示，可以看到针对干细胞的研究论文数量，2022年为8,578篇。国家分布
可以看到，

中国发表的研究论文数量为3,727篇，占34.1%，居第一位；
美国发表的文章数占23.6%
，排在第二位
；

日本
、伊朗和
德国
分列第三到五位。
（SCI论文的时间和国家分布）


学术机构排名
四川大学、斯坦福大学医学院、中南大学、浙江大学、华中科技大学
等所在大学发表的论文最多。

华西医院、华西口腔医院、同济医学院协和医院、德克萨斯大学MD安德森癌症中心、梅奥诊所等是发表论文最多的医院。
（全球发表论文的机构排名）
研究热点基因和相关疾病
如下图所示，显示MOR、STAT3、SOX2、SIRT1、CXCR4 等是干细胞研究中最受关注的位点。
白血病、乳腺癌、脊髓损伤、多发性骨髓瘤、糖尿病等是干细胞研究中最关注的疾病。
干细胞研究也涉及中风、骨关节炎、大肠癌、贫血、胃癌、SARS-CoV-2、肺癌、脑损伤、多发性硬化症、骨质疏松症等疾病。
（干细胞研究相关的基因和疾病）
哪些期刊喜欢干细胞研究？


可以看到发表干细胞相关研究最多的五个杂志是Stem Cell Res Ther (IF=8.1) 、 Int J Mol Sci (IF=6.2) 、 Stem Cell Res(IF=1.6) 、 Cells (IF=7.7)、 Front Cell Dev Biol
(IF=6.1) 等。

需要注意的是，IF=-1的标记意味着该期刊尽管被Medline数据库收录，但不是SCI收录期刊；尤其是其中的很多是
掠夺性期刊，投稿时要特别小心。
（发表论文的杂志分布）
我们也附上部分期刊的影响因子、分区、从投稿到接受的天数等，对于投稿有非常重要的参考价值。

最有影响力学者
及其关系网。

国际
干细胞
研究论文中

最有影响力的学者。

（学术大咖及其关系网。）

学者影响力是基于学者在该领域的论文影响因子总分。
其中斯坦福大学医学院的Bertaina, Alice；意大利IRCCS San Raffaele Scientific Institute的Fumagalli, Francesca；科罗拉多大学的Kamdar, Manali；斯坦福大学医学院的Rando, Thomas A；意大利IRCCS Bambino Gesù Children's Hospital的Locatelli, Franco等是干细胞研究领域最为活跃的学者。

二，干细胞研究领域的经典论文
除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外（数量+质量），单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。

所以我们通过大数据分析找到高引用论文，即领域内的经典论文。
高影响力的SCI论文为：
  • Fumagalli Fet, et al. Lentiviral haematopoietic stem-cell gene therapy for early-onset metachromatic leukodystrophy: long-term results from a non-randomised, open-label, phase 1/2 trial and expanded access. Lancet. 2022 Jan 22;399(10322):372-383. doi: 10.1016/S0140-6736(21)02017-1. PMID: 35065785; PMCID: PMC8795071.(Clinical Trial)[1]
  • Kamdar M, et al. Lisocabtagene maraleucel versus standard of care with salvage chemotherapy followed by autologous stem cell transplantation as second-line treatment in patients with relapsed or refractory large B-cell lymphoma (TRANSFORM): results from an interim analysis of an open-label, randomised, phase 3 trial. Lancet. 2022 Jun 18;399(10343):2294-2308. doi: 10.1016/S0140-6736(22)00662-6. Erratum in: Lancet. 2022 Jul 16;400(10347):160. PMID: 35717989..(Clinical Trial)[2]
  • Speck NA. A Pernicious Cycle Affecting Premalignant Stem Cells. N Engl J Med. 2022 Feb 10;386(6):596-598. doi: 10.1056/NEJMcibr2117528. PMID: 35139279.[3]
  • Bertaina A, et al. Sequential Stem Cell-Kidney Transplantation in Schimke Immuno-osseous Dysplasia. N Engl J Med. 2022 Jun 16;386(24):2295-2302. doi: 10.1056/NEJMoa2117028. PMID: 35704481.[4]
  • Abbasi J. Reducing Graft-vs-Host Disease in Blood Stem Cell Transplants. JAMA. 2022 Feb 8;327(6):517. doi: 10.1001/jama.2022.0728. PMID: 35133428.[5]
被引用次数最多的论文为：
  • Du Y, et al. Human pluripotent stem-cell-derived islets ameliorate diabetes in non-human primates. Nat Med. 2022 Feb;28(2):272-282. doi: 10.1038/s41591-021-01645-7. Epub 2022 Feb 3. PMID: 35115708.[6]
  • Oikawa M, et al. Functional primordial germ cell-like cells from pluripotent stem cells in rats. Science. 2022 Apr 8;376(6589):176-179. doi: 10.1126/science.abl4412. Epub 2022 Apr 7. PMID: 35389778.[7]
  • Ang LT, et al. Generating human artery and vein cells from pluripotent stem cells highlights the arterial tropism of Nipah and Hendra viruses. Cell. 2022 Jul 7;185(14):2523-2541.e30. doi: 10.1016/j.cell.2022.05.024. Epub 2022 Jun 22. PMID: 35738284.[8]
  • Mazid MA, et al. Rolling back human pluripotent stem cells to an eight-cell embryo-like stage. Nature. 2022 May;605(7909):315-324. doi: 10.1038/s41586-022-04625-0. Epub 2022 Mar 21. PMID: 35314832.[9]
  • Okano H. A combined stem-cell-gene therapy strategy for ALS. Nat Med. 2022 Sep;28(9):1751-1752. doi: 10.1038/s41591-022-01983-0. PMID: 36097225.[10]
三，如何开启自己的自噬研究
除了前面内容，您已经深信不疑的是：自噬
研究很值得做。尤其是研究生选
题，可能这是一辈子课题的好起点。
问题是：如何开始呢？
最简单的方法：从模仿，到超越。
A，基础研究：
在研基金
比如ROCKEFELLER UNIVERSITY的Fuchs, Elaine目前在研的3项课题，专注于皮肤组织的干细胞再生：
发表的论文
如ROCKEFELLER UNIVERSITY的Fuchs, Elaine：
  1. (2022) Relocation sustains intestinal stem-cell numbers Nature [11]
  2. (2022) Lymphatics act as a signaling hub to regulate intestinal stem cell activity Cell stem cell [12]
  3. (2021) Stem cells expand potency and alter tissue fitness by accumulating diverse epigenetic memories Science (New York, N.Y.) [13]
B，转化医学：
在研基金
比如Stanford University School of Medicine神经科的Rando, Thomas A目前在研的9项课题，专注于干细胞在衰老、退行性病变中的干预与机制研究：
1) Aging and Stem Cell Resilience

2) Molecular Regulation of Stem Cell Quiescence

3) Epigenetic Reprogramming of Cellular Age

4) Mechanisms of adipogenic and fibrotic degeneration of muscle

5) Molecular Regulation of Stem Cell Aging

6) Complement Components as Mediators of Cell and Tissue Aging
发表的论文
如Stanford University School of Medicine神经科的Rando, Thomas A，
  1. (2022) Scalable macroporous hydrogels enhance stem cell treatment of volumetric muscle loss Biomaterials [14]
  2. (2022) Ageing and rejuvenation of tissue stem cells and their niches Nature reviews. Molecular cell biology [15]
  3. (2022) Fasting induces a highly resilient deep quiescent state in muscle stem cells via ketone body signaling Cell metabolism [16]
  4. (2022) ATR activity controls stem cell quiescence via the cyclin F-SCF complex Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America [17]
  5. (2022) Tubastatin A maintains adult skeletal muscle stem cells in a quiescent state ex vivo and improves their engraftment ability in vivo Stem cell reports [18]
Hanson解读：
通过针对干细胞论文的大数据分析，我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1）干细胞研究，目前是医生科学家最好的切入时机。一方面，干细胞的机制已经比较清楚；另一方面，目前针对干细胞
在不同病理状态下的激活/抑制干预效果研究还远远不够。

2）针对
干细胞研究，目前发表了162,328篇Medline论文，且论文数量快速增长。且有非常高的比例发表在高质量期刊上。
发文最多期刊是Stem Cell Res Ther (IF=8.1) 、 Int J Mol Sci (IF=6.2) 、 Stem Cell Res(IF=1.6) 、 Cells (IF=7.7)、 Front Cell Dev Biol (IF=6.1) 等。有15.1%的研究发表在影响因子大于9分的期刊。
3）干细胞研究领域广泛，除了组织再生、衰老、移植等研究外，在代谢疾病等领域都有研究开展。美国NIH资助的基金连续10年在5000-8500项
！

4
）针对干细胞研究最有影响力的论文
，已经由机制探索、细胞和动物实验，转向临床转化和研发
。
5）由于我们的专业知识所限，本大数据分析可能存在误差；且仅为学术交流用，不用于任何排名或者比较。也期待各位专家点评及提出改进意见。

6）更多研究靶点分析报告，在本公众号主页面下回复“靶点”查看；如回复“肿瘤科”或“外泌体”，获得对应研究领域推送资料。
写在最后：
临床科研的重点是转化成诊治方案，而必经之路是临床试验。

根据clinicaltrials，在干细胞研究领域，至2022年10月，已经有9,376项在研的临床试验
，期待这些研究能够验证出有效的方案，尽快造福于患者。

既往相关推文：
大数据解析"干细胞"：道路曲折、热度不减，终于到了临床科研的收获期！从这里开启自己的研究吧
编辑：Henry，微信号：Healsan。
作者简介：美国Healsan Consulting(恒祥咨询)，专长于医学生物大数据分析、临床科研设计和SCI论文深度润色；并提供上述服务，包括针对您课题的大数据分析。
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