在基因组测序方面，英国政府向来是敢为人先，推动技术应用也是不遗余力，这次又来了：投入2千万英镑，启动新冠病毒全基因组测序联盟，对所有确诊病例的病毒样本进行全基因组测序，绘制冠状病毒扩散分布图。
COVID-19 Genomics UK联盟由英国NHS、英国公共卫生机构(Public Health England)、Wellcome 桑格研究所和诸多学术机构组成，将提供大规模、快速的病毒序列信息，并与医院、区域NHS中心和政府共享。确诊病例为COVID-19的患者样品将被送到12个测序中心进行全基因组测序，以帮助在全国范围内监视病毒的变化，了解病毒的传播方式以及是否出现了不同的病毒株。这将为控制大流行，防止进一步蔓延和帮助患者进行临床护理提供战略依据。它还可以帮助指导将来的治疗，并了解干预措施的可能影响。
危机当下，从实施的技术角度来看，病毒的全基因组测序一定是illumina平台和nanopore分布式测序的结合，甚至看到有实验室在问是否可以把闲置的毛细管电泳测序搬出来用于增加产能。想必联盟会在测序和生物信息学方法的开放性、验证、数据集快速积累发布共享等方面作出规范。

基因序列是理解疾病发生发展的一个线索，由此产生的更多见解和知识可能更好地帮助干预病毒的传播，测序样本的数量可能不是解决问题的根本办法，但是信息及时传播并告知一定是有效的。
英国是在基因组学研究、技术开发及应用方面一直保有领先，但尽管拥有所有先进的技术，在这样突发的疫情之下，医疗体系的脆弱性和科学研究的前瞻性不足都是不言而喻的。像之前的ICGC/International Cancer GenomeConsortium这样的国际合作项目提供了很好的成功经验，开放共享的模式也产生了相当大的影响力。英国在COVID-19基因组联盟上的实践可能也会复制到其他国家地区，同时可能也需要与已经积累了不少经验的中国等一起工作，才能最大化工作的价值，为后续科研临床及公共预防产生更有影响力的数据库资源。

知识改变命运，数据拯救生命。要我说，英国应该在全基因组测序方面再加把劲，索性把确诊病例中的病毒和人两个样本的基因组全测了，对患者进行基因分型，把基因分型与疾病的严重程度、免疫反应甚至是治疗干预的效果相关联。这样的努力一定更会为人所称道。
看到网友评论说，很高兴政府开始关心病毒的演化了，但我真的很想知道为什么检测能力还没有提升？
注：图片来源于网络。
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