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让科研和SCI论文成为临床工作的副产品。
(👆,仅限于医生生物科研者
关键词:NLRP;免疫疗法;基金;临床科研
导言:
国自然基金撰写正酣,我们继续通过对“NLRP
”研究论文的大数据分析,解析做针对这个靶点的科学研究。

熟悉我们大数据分析的朋友可能已经发现了,针对2021年研究论文的大数据分析中,很多领域的最热门研究靶点/基因是
NLRP3

对,因为NLRP3已经过基础研究的反复锤炼,进入到临床科研阶段

美国国立卫生研究院(NIH)资助的NLRP3研究项目,由2012年的71项,到2021年的208项。
(美国NIH资助的NLRP3研究项目,由2012年的71项,到2021年的208项)
为什么是NLRP3
NLR是固有免疫模式识别受体中的一个重要家族,是启动固有免疫应答的关键。NLR家族具有三种基本的结构域:LRR(C端)、NACHT(中央区)、效应结构域(N末端);从N端结构域不同这一角度,分为5个亚族:NLRA、NLRB、NLRC、NLRP和NLRX1。NLRP是最大的NLR亚族,有14个成员 (NLRP1-14),共同点是N末端存在 pyrin 结构域(PYD)。
NLRP不参与炎症介质的转录激活,但参与细胞焦亡,同时也是调节caspase-1激活的炎症小体的组成部分(参与炎症小体形成的NLR家族成员:NLRC4、NLRP1、NLRP3、NLRP2、NLRP6、NLRP7和NLRP12)。NLRP的异常表达和炎症小体的过度激活驱动、影响了免疫性疾病(包括IBD、RA、SLE、银屑病、MS和糖尿病)、感染性疾病的发生、发展。
(经典NLR 信号通路的示意图
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33589796/ )
激活炎性小体NLRP3的机制
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7744443/
目前,虽然针对靶向NLR的多种药物研发尚未能成功,其中研究最广泛的是NLRP3;NLRP3抑制剂已在SLE治疗中获得显著成果,并希望用其治疗存在慢性炎症驱动的疾病——除了之前提到的疾病,还有纤维化(包括NASH和特发性肺纤维化)、神经退行性疾病(包括帕金森、阿尔茨海默症)等。(PMID: 26121197)
NLRP研究近年已成为顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点
NLRP研究论文13.0%发表在9分以上期刊2.9%发表在24分以上期刊;并且最近几年的论文发表数量增速堪比火箭。绝对是万众瞩目的热点。

(NLRP研究发表的期刊分布及时间分布)

为了解目前在NLRP领域的研究进展,我们对发表的论文做了全面解读,以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢NLRP研究,目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。
检索数据库:
Medline

检索工具:文献鸟/PubMed检索时间:February 19, 2022检索及分析机构:
Healsan Consulting LLC(美国恒祥咨询); Stork(文献鸟)


一,NLRP研究论文大数据分析
NLRP
研究论文发表的时间和国家分布
全球已经在NLRP领域发表了11,682篇Medline收录的文献;文献鸟则检索到11,589篇,对其中的10,986篇进行分析。
时间分布显示,可以看到针对NLRP的研究论文数量,2018年有1,172篇,2021年为2,692篇。国家分布
可以看到,
中国发表的研究论文数量为5,236篇,占47.7%
,位居第一;

美国发表的文章数占22.0%
,排在第二位;
德国
、日本和
意大利
分列第三到五位。
(SCI论文的时间和国家分布)
学术机构排名
中南大学、复旦大学、南方医科大学、中国医药大学(中国,台湾)、山东大学、南京医科大学、华中科技大学、浙江大学、中山大学、南京大学、吉林大学、首都医科大学在大学为单位的论文发表排名中居前十二名。

St. Jude Children's Research Hospital、 武汉大学人民医院、同济医学院附属协和医院、 南方医院、 哈尔滨医科大学附属第一医院、 吉林大学第一医院、 中南大学湘雅二医院、 复旦大学附属中山医院、 青岛大学附属医院、 郑州大学第一附属医院、 重庆医科大学第一附属医院是发表论文最多的前十一所医院。

(全球发表论文的机构排名)
研究热点基因相关疾病

如下图所示,显示NLRP3、NLRP1、TLR4、TXNIPAIM2等是NLRP
研究中最受关注的位点。

结肠炎、关节炎、糖尿病脑损伤和败血症等是NLRP研究中最关注的疾病。
(NLRP研究相关的基因和疾病)
NLRP研究
关键词
包括NLRP3、炎症小体、激活、损伤炎症等。


哪些期刊喜欢NLRP研究?
可以看到发表NLRP相关研究最多的五个杂志是Front Immunol (IF=7.6)、 Int Immunopharmacol (IF=4.9)、 Sci Rep (IF=4.4)、 Int J Mol Sci (IF=5.9)、 PLoS One (IF=3.2)等。
(发表论文的杂志分布)
最有影响力学者
及其关系网。

国际NLRP
研究论文中

最有影响力的学者。
(学术大咖及其关系网。)
学者影响力是基于学者在该领域的论文影响因子总分
其中St. Jude Children's Research HospitalKanneganti, Thirumaladevi;波恩大学医院(德国)Latz, Eicke山东大学齐鲁医学院Wu, Hao北卡罗来纳大学教堂山分校Ting, Jenny Py斯耶鲁Ludwig-Maximilians-Universität München(德国)Dixit, Vishwa Deep密歇根大学医学Núñez, Gabriel澳洲国立大学Man, Si Ming;加州大学洛杉矶分校医学院Xia, Tian杜克大学Miao, Edward A等在NLRP研究领域最为活跃。
二,NLRP研究领域的经典论文
除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外(数量+质量),单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。

所以我们通过大数据分析找到高引用论文,即领域内的经典论文。

从下图可以看出
NLRP
研究领域论文的爆发,及经典论文的分布。

最受关注的10篇论文,多涉及Kmirah(Tisagenlecleucel)、 阿基仑赛(axicabtageneciloleucel,奕凯达), B 细胞淋巴细胞白血病,CD4+、CD8+、CD19,NLRP 细胞疗法的毒性评估和管理指南,与接受NLRP治疗的患者的重症管理研究。这些论文是NLRP研究的经典论文,也是必读和必引论文。
如果我们只看最近发表的重要论文时,可以看到2022年新发表的论文中,主要为具体疾病相关NLRP机制研究NLRP结构相关的机制研究涉及的疾病主要包括心肌梗死、动脉粥样硬化、肝病、免疫代谢调节剂、难治性关节炎、自发性炎症和纤维化、肝星状细胞活化、肝纤维化:涉及到的研究重点、生物学过程包括:炎症小体、 细胞因子释放抑制剂 CRID3、 感染、 IL-1、 NLRP12、 NLRP3、 NLRP1、 DPP9、 Gasdermin D、细胞死亡、 细胞焦亡的研究等。
三,如何开启自己的NLRP研究

看了前面内容,您已经深信不疑的是:
NLRP研究很值得做。尤其是研究生选题,可能这是一辈子课题的好起点。
问题是:如何开始呢?
最简单的方法:从模仿,到超越。基础研究学者:
比如波恩大学医院免疫学部的Latz, Eicke。
临床科学家:
可以参考山东大学齐鲁医学院的Wu, Hao,发表的系列研究论文,机制结合临床研究,由浅入深。
做转化
则可以参照Genentech 的Dixit, Vishva M,致力于药物的基础研究开发。

而最容易的切入点还是经典一套A因子/蛋白通过B信号通路途径调控了(抑制/增强)NLRP*从而抑制/增强了C疾病/细胞D功能

如齐鲁医学院的Wu, Hao的这篇文章标题的描述。
或者美国在研基金的题目。
小结
通过针对
NLRP论文的大数据分析,我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1)
NLRP研究,目前是医生科学家最好的切入时机。一方面,已经清楚了一部分NLRP的机制;另一方面,目前针对NLRP
在不同疾病中的干预效果研究还远远不够。

2)针对
NLRP研究,目前发表了11,682篇Medline论文,且论文数量快速增长。且有非常高的比例发表在高质量期刊上。中国、美国、德国、日本和意大利在NLRP
研究中处于领先。

3)
NLRP研究发文最多期刊Front Immunol (IF=7.6)、 Int Immunopharmacol (IF=4.9)、 Sci Rep (IF=4.4)、 Int J Mol Sci (IF=5.9)、 PLoS One (IF=3.2)等。13.0%的研究发表在影响因子大于9分的期刊,2.9%发表在24分以上期刊。
4
NLRP研究领域广泛
,除了癌症,在感染性疾病、自身免疫病等领域都有研究。

5
)针对
NLRP研究最有影响力的论文
,已经由机制探索、细胞和动物实验,转向临床转化和研发。

6)由于我们的专业知识所限,本大数据分析可能存在误差;且仅为学术交流用,不用于任何排名或者比较。也期待各位专家点评及提出改进意见。
7)如果您对这个临床科研项目有兴趣,且想对自己的课题进行大数据分析及美国在研项目检索,可与科研助手联系有偿服务。
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编辑:Henry,微信号:Healsan
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