GSEA开发者们联合推出的重磅单细胞数据库
助你扫清单细胞数据的一切障碍
HI，大家好，我是晨曦，这期是晨曦单细胞数据库系列的第六弹，旅途已经过半，各位同学可千万不要掉队哦~
晨曦单细胞数据库系列传送门
宝儿，5min掌握一个单细胞数据库，今年国自然就靠它了！（附视频）
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零成本装逼指南！单细胞时代，教你用单细胞数据库巧筛基因，做科研！
这期我们介绍的数据库是由大名鼎鼎的broad研究所建立的，其目的在于为使用者打通单细胞分析障碍，加速单细胞研究，这个甚至称为了一个口号被挂在了这个数据库的网页上，界面如下：
那么闲话少叙，我们就开始今天的学习吧~
主页
我们在浏览器键入网址：Single Cell Portal (broadinstitute.org)
进入Single Cell portal数据库，然后界面如下：
晨曦解读
我们从主页界面可以得到几点信息
1.该数据库目前包含379项研究，共计14,223,699细胞（十分庞大的数据）
2.该数据库提供两种检索模式，分别是Studies（研究项目）检索和Gene（基因）检索
3.检索栏下方可以看到Studies简介，以及包含的细胞数量
4.提供了新型冠状病毒相关的数据信息
这四点信息在界面的位置如下展示：
至此，主页介绍完毕
数据查询
接下来，我们尝试进入结果页面，我们通过在检索框中输入我们感兴趣的内容
以Gene symbol为PTEN为例子
晨曦解读
可以看到，我们按照Gene symbol进行检索后，检索到的内容展现形式是按照Studies的形式进行组建的，也就是说本质上来说，我们进行Studies或者Gene这两种检索模式进行检索，只不过是输入关键词的不同而已，检索的结果展现形式是一样的
我们点击第一个Studies，进入到结果详细页面
晨曦解读
结果展示界面主要包含三部分，分别是Studies的简述，Explore（简单查看数据）以及数据下载
这里我们点击Explore（简单查看数据），我们可以查询到该Studies的细胞亚群分类情况
然后这里我们如果想要探索，在该研究中某个基因的表达情况，我们可以在Explore下的搜索框中键入我们感兴趣的内容，示例如下：
如果想要更进一步，加上分组信息，我们可以点击Distribution，展示查询基因在不同亚群或者不同分组下的表达情况
至此，数据查询介绍完毕
数据下载
下面我们进行数据下载，也是十分的简单，直接点击Studies中的Download即可
这个数据库要是想要下载数据，首先得需要去注册，但是注册流程也是十分的常规，毕竟Broad研究所并没有想要在这个上面设限~
然后下载界面提供了很多格式类型的数据下载，直接选择想要的下载文件即可~
至此，该数据库就给大家介绍到了这里，感兴趣的小伙伴可以抓紧实际操作一下哦~
总的来说，这个数据库算的上是颜值高+数据量大+操作简便，简直就是居家分析单细胞的不二选择哦~
那么，晨曦单细胞数据库系列第六弹就结束啦~
我是晨曦，我们下期再见~
晨曦单细胞笔记系列传送门
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晨曦从零开始学画图系列传送门
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撰文丨晨   曦
排版丨四金兄
主编丨小雪球
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