新冠病毒是一种RNA病毒,最大的特点之一就是容易变异。
从疫情发展到现在,我们听了太多关于病毒变异的消息。
比如欧洲流行的D614G突变、丹麦流行的水貂新冠病毒变异株、英国流行的变异毒株、南非流行的变异毒株等……
实际上,病毒突变造成的影响可能很小;但如果变异改变了新冠病毒的传染性、毒力和疫苗的保护效果,影响也可能非常大。
那么,目前这些主流的变异病毒对我们有什么影响呢?今天我们就一次性说清楚
针对每一种变异毒株,主要从4方面展开:
1. 病毒的哪个部位发生了变异?
2. 病毒致病性变化了吗?
3. 传染性增强了吗?
4. 疫苗还有效吗?
先解释一个概念:究竟什么是突变?
无论是DNA还是RNA的复制,都会产生错误,这种错误就是突变。而新冠病毒的遗传物质是单链RNA,非常不稳定,更容易发生突变。
2020年4月30日,美国洛斯·阿拉莫斯国家实验室发布了一篇论文,警告“D614G的感染人数正在以惊人的速度增加”
不过,7月2日发表在《细胞》(Cell)杂志上的论文,删除了前面提到的警告[1]
关于D614G突变,要知道这几件事:
1.关键位点突变,让病毒和人体细胞更容易结合
具体的突变从名字上就能看出来:
  • 614是指新冠病毒刺突蛋白上的第614个氨基酸残基;
  • 该位点,原有的编码是天冬氨酸(缩写D);
  • 突变后,变成了甘氨酸(缩写G)。
新冠病毒主要依靠刺突蛋白与人体细胞结合,而刺突蛋白上的第614个氨基酸位置又很关键,所以这种突变增强了新冠病毒与人体细胞的结合能力。
2.毒性没有变化
感染D614G变异毒株的患者,住院结局(新冠肺炎住院患者的症状)并没有加重,说明毒性并没有增加。
3.传染性变强
体外试验发现,D614G的变异毒株传染性强于原始毒株。D614G的变异毒株在出现短短几个月后迅速占据了主导地位。
4.没有影响疫苗的有效性
新冠肺炎康复者血清中的中和性抗体,对D614G突变病毒有同等或更好的效果,这说明疫苗对它还是有效的,而且效果似乎还更好了。
这篇论文在学术界也引起了强烈反响,主要集中在传染性增强的结论上[2-3]。2020年11月,来自英国伦敦大学、英国牛津大学、法国留尼旺大学的6位学者,在《自然》(Nature)上发表论文称[4],D614G并没有造成什么额外的影响。
N501Y突变大名鼎鼎,直接导致伦敦封城。
近期风头最盛的英国变异毒株B.1.1.7、南非变异毒株B.1.351 (501Y.V2)、巴西的变异毒株P1,虽然看起来是在三个国家独立出现,但它们携带着几个共同的基因变异,比如都有N501Y突变。(注:三者的突变位点各不相同)
01先来看英国发现的突变病毒
1.N501Y突变意味着:
  • 刺突蛋白的第501个氨基酸残基发生变化。
  • 编码的氨基酸从天冬酰胺(缩写N)变成了酪氨酸(缩写Y)。
刺突蛋白的第501位氨基酸能直接影响病毒与人体细胞的结合。
2.病毒传染性显著变强了
2020年12月18日,英国发现N501Y变异毒株感染者的增长率,比其他变异毒株高71%,这可能让病毒的基本传染数(R0值)增加0.39~0.93[5]
增长率是指,每天病例增加或减少的速率(减少时为负数),由此可算出第二天比第一天增加或减少了多少感染者[5]
R0值是指,没有外力介入且所有人都没有免疫力的情况下,一个感染者会把疾病传染给多少个人的平均数。哪怕相同的毒株,在不同的时间、不同的地点,上述两个值也存在差异,所以它们的变化不一定完全是由病毒变异造成的。
简单理解就是,N501Y突变让病毒的传染性变强了。
3.住院患者死亡风险增加
2021年1月21日,英国发布消息称,新变异病毒感染者的住院死亡风险增加,但不同的研究结论不一致,还需要更多研究和更长时间的观察[7]
4.没有发现影响疫苗效力
英国首席科学顾问帕特里克·瓦伦斯在1月22日表示,疫苗对新病毒的预防效力,和对旧病毒的一样有效[8]
02再来看南非和巴西的变异毒株
这两个突变毒株同样鼎鼎有名。它们有着相同的关键节点突变——E484K突变,也就是刺突蛋白第484位氨基酸发生变化,从谷氨酸(E)变成了赖氨酸(K)。
网上热议,这个变异会导致疫苗失效。但其实这一观点是对一篇论文的误读。
2021年1月4日,美国福瑞德·哈金森癌症研究中心发布的论文指出,存在E484K突变的病毒会使康复者的中和抗体(能干掉进入体内的病毒)效力下降,最高可下降10倍以上[9]
但这只能说明,康复者对具有E484K突变的病毒防御力降低,并不能说明疫苗的效力变化
从理论上推算,疫苗不太可能完全失效,主要原因有三:
其一,疫苗与单纯感染不同疫苗接种程序一般包括多次接种,从而强化免疫,获得更强的保护效果。
其二,各类疫苗都能针对病毒的大部分抗原位点,产生更广泛的保护效果。尤其是腺病毒载体疫苗和mRNA疫苗,还能引起强烈的细胞免疫应答,从而发挥更强的保护效果。
其三,E484K这个单一位点的突变,减弱的仅仅是一部分中和抗体(体液免疫)的保护效力,而不会影响细胞免疫的保护作用。
美国作为新冠病毒感染人数最多的国家,必然存在着新的突变毒株。
2021年1月13日,南伊利诺伊州大学的研究团队介绍了美国的突变毒株[10]
(论文截屏)

(注释:这篇论文更改后于1月19日重新发布)
1.哪里发生了突变?
这个变异毒株被称为20C-US,是2020年5月在得克萨斯州发现的,主要突变发生在刺突蛋白的Q677H或Q173K。
2.传染性、毒性变化、对疫苗效力的影响,都还不清楚
这个新毒株的传染性、毒力改变到底如何,还有待考证。
论文作者认为,Q677H突变可能会影响病毒进入细胞的效率;Q173K突变具有改变抗体识别的潜力,但还需要更多研究
这个变异毒株目前还没有传播到我国,所以暂时无需过多关注。
到这里我们都知道了,南非变异毒株B.1.351 (501Y.V2)、巴西的变异毒株P1会使得疫苗的效力下降,但目前还没有证据表明,现有的新冠疫苗会失去对变异毒株的免疫保护效力
尽管如此,面对病毒变异,我们已经有行动
先来看中国的疫苗,根据国药集团官网公布的信息[11]该公司生产的灭活疫苗在2020年12月30日附条件上市时,经试验证实,其对全球不同地区的毒株都有很好的效力。至于对新出现的变异毒株是否有效力,还在研究中。
(来源:国药集团官网)
再看美国的mRNA新冠疫苗,莫德纳(Moderna)1月25日宣布,该公司生产的疫苗在体外研究中,表现出对英国、南非变异毒株的效力[12]
具体来说,对于英国的变异毒株,该疫苗的免疫保护效力也没有明显变化。
对于南非的变异毒株,疫苗的效力下降了 3~6 倍,但它仍然具有免疫保护效力。
就算疫苗效力有所下降,我们也依旧有办法——
  • 莫德纳将注射额外剂量的mRNA疫苗,来测试能否提高免疫保护效力
  • 针对南非变异毒株,将开发强化免疫候选疫苗(mRNA-1273.351),看能否增强针对新毒株的免疫保护效力。
不过,无论这些变异毒株的实际影响力如何,我们都应该严肃对待新冠病毒。(注:需要注意的是,文章中提到的预印本论文并未通过同行评议正式发表,其结论现在不能被认为是完全可靠的结论,本文引用仅供参考。
突变不可控,如果放任病毒传播,完全有可能出现毒性更强、传染力更强、令疫苗无效的超级毒株,而我们始终要记住:戴好口罩、勤洗手、少去人员密集的地方,因为不管病毒如何变异,这3项措施对预防新冠感染都是有效的。
审稿专家:罗天明 | 北京大学基础医学院博士后
参考文献
[1]Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S, et al. Tracking Changes in SARS-CoV-2 Spike: Evidence that D614G Increases Infectivity of the COVID-19 Virus. Cell. 2020;182(4):812-827.e19. 
[2]Grubaugh ND, Hanage WP, Rasmussen AL. Making Sense of Mutation: What D614G Means for the COVID-19 Pandemic Remains Unclear. Cell. 2020;182(4):794-795. 
[3]Ewen Callaway. The coronavirus is mutating — does it matter? Nature. 2020; 585: 174-177.
[4]van Dorp L, Richard D, Tan CCS, et al. No evidence for increased transmissibility from recurrent mutations in SARS-CoV-2. Nat Commun. 2020;11(1):5986.
[5]NERVTAG UK. Meeting on SARS-CoV-2 variant under investigation VUI-202012/01.
https://khub.net/documents/135939561/338928724/SARS-CoV-2+variant+under+investigation%2C+meeting+minutes.pdf/962e866b-161f-2fd5-1030-32b6ab467896?t=1608470511452
[6]Julia Gog, Rachel Thomas, Marianne Freiberger. The growth rate of COVID-19.
https://plus.maths.org/content/epidemic-growth-rate
[7]SAGE meeting paper: Cover sheet.
https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/955239/NERVTAG_paper_on_variant_of_concern__VOC__B.1.1.7.pdf
[8]Tim Locke. UK COVID-19 Update: 'Higher Mortality' With New Variant, R Down, No 'Cash for Compliance' - Medscape - Jan 22, 2021.
[9]Greaney AJ, Loes AN, Crawford KHD, et al. Comprehensive mapping of mutations to the SARS-CoV-2 receptor-binding domain that affect recognition by polyclonal human serum antibodiesexternal icon. bioRxiv. [Preprint posted online January 4, 2021]
[10]Pater AA, Bosmeny MS, Barkau CL, et al.  Emergence and Evolution of a Prevalent New SARS-CoV-2 Variant in the United States. bioRxiv. [Preprint posted online January 13, 2021]
[11]【新华社】新冠病毒疫苗两针咋打最有效?保护期如何?专家详解
http://www.sinopharm.com/s/1223-4126-38929.html
[12] Moderna COVID-19 Vaccine Update. January 25th, 2021.
https://investors.modernatx.com/static-files/1f770088-5909-457b-af99-7ff2454ba28a
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