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关键词:RET;临床科研;课题设计
导言:
2020年12月1日,美国Blueprint Medicines研发的Pralsetinib获得美国食品和药品管理局(FDA)加速批准,用于治疗携带RET变异的甲状腺癌患者;包括12岁以上需要全身治疗的晚期或转移性RET突变甲状腺髓样癌(MTC)患者,或需要全身治疗且放射性碘难治性晚期或转移性RET融合阳性甲状腺癌患者。
这是癌症精准医疗的有一个突破。
(数据库1,不同癌症中RET 突变(绿色)和融合阳性(紫色)比例)
(数据库2,不同癌症中RET 突变(绿色)和融合阳性(紫色)比例)
RET融合和突变是许多癌症类型(包括甲状腺癌,非小细胞肺癌)的关键驱动因素。如上面两个图所示,我们通过生物信息学分析,可以看到约6%的甲状腺癌患者、1%的非小细胞肺癌患者携带RET融合。此外,RET融合也在胃食管癌、结直肠癌、前列腺癌、卵巢癌和急性髓细胞白血病等其他癌症类型中较低频率出现。
1,美国国立卫生研究院(NIH)基金资助方向
美国目前已经资助的RET课题主要涉及中枢神经系统、甲状腺、输尿管、乳腺癌、生殖细胞精子发生、遗传性癌症综合征等
(美国NIH资助的RET研究方向)
2,中国研究相对薄弱
如下图所示,目前在RET研究领域已经发表了2673篇Medline收录的论文,中国只有245篇,占9%。
RET研究发表的期刊分布及时间分布
为了解目前在RET研究领域的研究进展,我们对发表的论文做了全面解读,以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢RET研究,目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。
检索数据库:
Medline

检索工具:文献鸟/PubMed
检索时间:December 07, 2020
检索及分析机构:Healsan Consulting LLC(美国恒祥咨询); Stork(文献鸟)
一,
RET研究论文大数据分析
研究热点基因
和相关疾病
如下图所示,甲状腺癌、Hirschsprung病(先天性巨结肠)、肺癌、嗜铬细胞瘤、成神经细胞瘤等是RET研究中最关注的疾病。除了肿瘤研究,其他帕金森病、肌萎缩侧索硬化等等非肿瘤疾病也开始关注RET研究。
RET研究相关的基因和疾病
RET研究都发表在哪些期刊
可以看到发表RET相关研究最多的五个杂志是Oncogene, J Clin Endocrinol Metab, Thyroid, Cancer Res, J Bio Chem等。
杂志后面附有影响因子,参考这个排名及影响因子,对于投稿有非常强的参考价值。
可以看到,RET研究有很高比例发表在10分以上期刊。
(发表论文的杂志分布)
最有影响力学者
及其关系网。
国际RET
研究论文中最有影响力的学者。

(学术大咖及其关系网。)
学者影响力
是基于学者在该领域的
论文影响因子总分。
从大数据分析看,美国的纪念斯隆凯特琳癌症中心的Drilon, Alexander,美国哈佛医学院的Eng, C;日本名古屋大学的Takahashi, M;意大利的Santoro, M;和加拿大的Mulligan, L M等是RET研究领域最活跃的学者
二,
RET领域的经典论文
除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外(数量+质量),单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。

所以我们通过大数据分析找到高引用论文,即领域内的经典论文。
被引用最多的6篇论文,多涉及RET被确认为癌症的致病因素研究。这些论文是RET研究的经典论文,也是必读和必引论文。
如果我们只看最近发表的重要论文时,可以看到2020年新发表的论文中,已经进入到针对癌症的治疗药物临床试验
我们更关注,作为主治医师层面的医生还可以做哪些课题。
下面的截图显示,针对RET变异癌症的影像学研究、RET融合阳性癌症的其他生物标记研究、以及其他一些疾病中的RET融合阳性及突变比例等研究非常多。
三,
如何开启自己的RET研究
RET研究很值得关注,尤其是研究生选题,可能这是一辈子课题的好起点。
问题是:如何开始呢?
最简单的方法:从模仿,到超越。
基础研究学者:比如意大利的University of Naples "Federico II"Santoro, Massimo的系列研究;他们在这个领域已经发表了29篇高质量的学术论文。
其在甲状腺癌RET研究领域的层层递进,非常非常值得借鉴。
加拿大Queen's University的Mulligan, Lois M的系列研究也很值得学习。
临床科学家:则可以借鉴意大利University Hospital of Pisa的Elisei, Rosella完成的20篇系列研究论文,从RET突变的比例、临床特点由浅入深;非常值得学习。
Hanson解读:
作为癌症精准医疗的重要代表,针对RET融合阳性和突变的研究备受重视。
通过针对RET论文的大数据分析,我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1)RET研究,目前仍然是医生科学家很好的切入时机。一方面,RET的机制已经比较清楚;另一方面,目前针对RET在不同疾病中的干预效果研究还远远不够。
2)针对RET研究,目前已经发表了2600余篇Medline论文,且
且有非常高的比例发表在高质量期刊上。
3RET研究领域越来越广泛,除了甲状腺癌和非小细胞肺癌,也扩展到其他癌症;并且开始在神经系统疾病领域受到关注。
4)针对RET研究最有影响力的论文,已经由机制探索、细胞和动物实验,转向临床试验;但目前基本上局限于甲状腺癌和非小细胞肺癌。
5)有很多作为主治医师/在读博士层面的医生可以做的课题,如针对RET变异癌症的影像学研究、RET融合阳性癌症的其他生物标记研究、以及其他一些疾病中的RET融合阳性及突变比例等研究非常多。
如果想做长期研究,可以参照我们找到的3位学者的长期系列研究
。这些策略也可以应用到其他癌症的类似研究中。

6)由于我们的专业知识所限,本大数据分析可能存在误差;且仅为学术交流用,不用于任何排名或者比较。也期待各位专家点评及提出改进意见。
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报告机构简介:
美国Healsan Consulting(恒祥咨询)公司,特长于医学生物大数据分析,为中国医学生物学者提供着从大陆直接申请美国绿卡和美国访问学者业务。
分析软件及致谢:
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