《柳叶刀》:新冠肺炎激素治疗弊大于利?
https://www.thelancet.com/pb-assets/Lancet/pdfs/coronavirus/S0140673620303172.pdf
近日,发表在《柳叶刀》上的一篇评论文章指出,根据以前爆发的类似传染病(如SARS)的相关证据,类固醇对冠状病毒感染者几乎没有什么临床益处,而且弊大于利。
不过文章提醒临床医生仍然应该对哮喘和其他炎症性疾病进行类固醇治疗。
医生经常使用类固醇来减轻炎症,而此次武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)患者的肺部也有这类炎症;冠状病毒所致的严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS)患者也可出现肺部炎症。
然而,类固醇也会损害人体免疫系统抵抗病毒和其他感染的能力,而对本已十分虚弱的病人遭受病毒感染可能会是致命的。文章指出,总的来说,使用类固醇可能会造成不可挽回的伤害。
一项针对感染MERS的危重患者的回顾性研究发现,接受类固醇治疗的患者中,近一半需要额外的治疗,如辅助呼吸、升压药和透析。接受类固醇治疗的患者被发现需要更长时间才能清除体内的病毒。
其他研究发现,类固醇对SARS感染者带来了负面影响——在感染后接受类固醇治疗3周的患者体内仍然存在这种病毒。
这篇评论文章的主要作者、爱丁堡大学危重病医学的学术顾问J.Kenneth Baillie博士说:“在此次2019-nCoV爆发期间,临床医生在如何治疗感染者方面面临着一些艰难的抉择。在仔细研究了现有的证据后,我们建议不要使用类固醇治疗这种新病毒引起的肺损伤。如果使用类固醇,它应该作为临床试验的一部分,这样我们就可以发现它们是在帮助还是伤害患者。
Insilico Medicine公开2019-nCoV关键蛋白靶点分子结构
美国时间2月6日,Insilico Medicine公司宣布将公布其靶向武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)3C样蛋白酶关键蛋白的小分子结构。Insilico将利用自己的资源和其合作伙伴慷慨提供的资源,合成和测试约100个分子。其余结构发布在公司网站上(https://insilico.com/ncov-sprint/),详细注释提交到预印本网站“bioRxiv”。
通过向公众提供这些结构,Insilico希望那些致力于发现2019-nCoV潜在疗法的人能够合成并测试这些分子。
人工智能(AI)药物研发的一个瓶颈是快速合成和测试分子的能力。先进的生成化学方法允许许多不同的分子结构被设计成具有各种性质的生成条件。然而,合成和验证可能需要一些时间,可能需要大量资源。因此,Insilico Medicine选择了约100个分子进行合成和测试,其余生成的结构存放在网站上。
为了加快合成和筛选,Insilico与国际上最大的开放研究平台通力合作,Insilico将提供其人员和资源来支持药物发现过程,旨在为全球抗击这一新的健康威胁作出贡献。
 “在这一困难时期,必须采用每一个有希望的方法来加快针对2019-nCoV的药物发现工作,包括使用我们端到端药物发现管线的生成化学部分。我们鼓励药物化学家评估生成的分子、提供反馈、并考虑对其进行合成。”Insilico Medicine首席执行官Alex Zhavoronkov博士说:“我们的内部团队也将合成和测试几种生成的化合物。”。
靶向2019-nCoV主要蛋白酶生成的结构的代表性示例。在ChEMBL数据库中使用相似度搜索来评估新颖性。ChEMBL ID号和最大相似系数被列出,“No”表示没有相似度>0.7的结构。
利用ChEMBL搜索工具,评估生成的结构与ChEMBL数据库中化合物之间的相似性。右边显示了来自ChEMBL、具有ID号的最相近分子以及ChEMBL相似性评分。

GenapSys “低成本迷你”测序仪助力病毒检测

在筹集9000万美元用以支持推出其紧凑型DNA测序硬件仅几个月后,GenapSys公司又筹集了7500万美元,为其全球扩张提供资金,其目光瞄准了亚太市场和当前的新型冠状病毒(2019-nCoV)疫情。
美国基因测序公司GenapSys的高通量、低成本、迷你新一代基因测序(NGS)仪(GenapSys™ Sequencer)安装于平板电脑上,重量不到10磅,作为最近25多项分销交易的一部分,它正在韩国、新加坡、日本和中国推出。
截至2月6日,世界卫生组织已经记录了来自25个国家的28250例2019-nCoV确诊病例和565例死亡病例。
GenapSys表示,中国疾病预防控制中心(CDC)已经与其接洽,以帮助提供测序支持。GenapSys目前正在寻求与当地卫生机构和研究人员、以及化验供应商和诊断开发人员进行合作,以帮助将其产品推广到该地区,并追踪不同的冠状病毒株和潜在的突变。
GenapSys称,其便携式测序仪的占地面积约为一张打印纸的大小,适用于通用的电源插座,可用于多种环境。
去年11月,GenapSys 完成了9000万美元的C轮融资,由Foresite Capital领投,主要看好其提供低成本分布式测序的能力。
据GenapSys官网介绍,GenapSys的迷你NGS测序仪GenapSys™每台售价约10000美元,采用直接接触半导体芯片,配备数百万个电子传感器,用以追踪核苷酸聚集时阻抗的变化。
GenapSys测序仪基于高精密度电流式基因测序技术,以专有的电微流控测序芯片为中心,利用电子信号检测碱基连接情况,其24小时内可提供超过1000万条平均长度为150bp的reads。
事实上,GenapSys的平台并不是第一个使用半导体芯片和电学检测的短读长测序仪。Thermo Fisher旗下的Ion Torrent是第一家推出基于半导体芯片的测序仪的公司。
Illumina也在2018年推出了半导体测序仪iSeq。
对此,GenapSys创始人兼首席执行官Hesaam Esfandyarpour博士表示:“GenapSys技术与其他系统有很大的不同。例如,其研究团队开发了以Ion Torrent技术为基础的新型电流式检测方法。新开发的GenapSys技术,可检测电阻抗变化信号,该变化是由核苷酸掺入与球珠结合的DNA中引起的。阻抗变化的大小与DNA分子及其周围电荷的总变化有关,即与结合核苷酸的数目有关。
从光学检测到电流检测的转变可大大降低测序成本。电流检测方式简单,且不需要任何光学器件、扫描仪或昂贵的分析服务器。因此可实现一种低成本测序,使得测序几乎可以在任何实验室内进行。据介绍,GenapSys包含16M芯片和试剂的测序试剂盒价格约为300美元,在样品制备系统上单次运行的扩增试剂盒价格也约为300美元。
GenapSys测序仪电流检测原理
GenapSys最近的这次融资来自Oxford Finance,使GenapSys的融资总额高达2.41亿美元。除在传染病领域,GenapSys还希望在癌症研究、个性化医学、食品科学、法医学和其他科学应用领域扩大其全球影响力。
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