导读
《自然》新闻8月8日消息,河北科技大学副教授韩春雨等人提出的一项基因编辑技术NgAgo面临重复性争议,这一争议也正在升级。
撰文 | David Cyranoski
编译 | 陈晓雪
责编 | 王承志
今年5月2日,河北科技大学副教授韩春雨与合作者发表在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)的一篇论文引发科学界关注。这篇论文显示,研究人员利用从格氏嗜盐碱杆菌(Natronobacterium gregoryi,简称Ng)——一种罕见的噬盐古细菌——中提取出来的Ago实现了DNA引导的基因组编辑,并发现NgAgo作为一种DNA介导的核酸内切酶,适合在哺乳动物细胞中进行基因组编辑。
现在,越来越多的科学家抱怨说他们不能重复韩春雨论文的结果,只有一位科学家告诉《自然》新闻可以重复。
韩春雨说,他现在每天收到很多骚扰电话和短信,嘲笑他完蛋了,但是他坚信他的技术是可靠的。他也告诉《自然》新闻,他已经应全球科学家质粒共享非盈利组织Addgene的要求,在线提交了一份更加详细的实验方案,希望这能够帮到其他科学家重复他的工作。《自然-生物技术》正在调查此事。
韩春雨
在论文中,韩春雨团队报告了使用NgAgo编辑了人体细胞中8个不同的基因,并在染色体的一些特定位置插入了基因。韩春雨说,至关重要的是,NgAgo特异性地只切除靶向基因,而不像CRISPR-Cas9有时会编辑错误的基因。同时,NgAgo不需要在切除位置附近使用特定的基因序列去激发活性,这也扩大了它的潜在应用范围,韩春雨说。
《自然》新闻说,对韩春雨论文的重复性争议始于7月初,当时方是民(网名方舟子)在他的网站新语丝(xys.org)称多名科学家告诉他无法重现韩春雨论文的结果。
方是民(网名方舟子)
7月29日,澳大利亚大学约翰·克汀医学研究中心(the John Curtin of Medical Research)的科学家加埃唐·布尔焦(Gaetan Burgio)发表博文公布了他在小鼠胚胎中测试NgAgo基因编辑效果的过程。他发现,无法再现韩春雨论文的结果。
加埃唐·布尔焦(Gaetan Burgio)
当天,西班牙科学家路易斯·蒙特柳(Lluis Montoliu)发邮件给他在国际转基因协会的同事,援引了布尔焦的案例,建议“放弃任何关于NgAgo的项目”。
路易斯·蒙特柳(Lluis Montoliu)
之后,英国爱丁堡再生医学研究所(MRC Centre for RegenerativeMedicine)的分子生物学家Pooran Dewari发起了一个在线调查,结果显示只有9位研究者认为NgAgo效果很好,97位研究者说它没效果。
两名最初于谷歌在线聊天群组中发言称成功使用NgAgo的科学家现在表示他们弄错了。位于印度新德里的CSIR基因组与综合生物学研究所的分子生物学家 Debojyoti Chakraborty 说他重复了韩春雨论文中的一部分,这部分描述了使用NgAgo来敲除一个已经插入细胞中的荧光蛋白基因。结果荧光减弱了,所以 Chakraborty 以为NgAgo已经敲除了基因。但是经过DNA测序后,他并没有发现有基因被编辑的证据。他现在认为荧光的减弱一定是由于其他原因。
德国海德堡癌症研究中心的遗传学博士研究生 Jan Winter 表示他也有类似的经历。他说:“我在接下来几周会重复实验,但目前我认为它(NgAgo)是无效的”。
韩春雨说,他发现他只在实验室的细胞中可以实现NgAgo的基因编辑效果,而在购买的细胞中失败了。他后来发现,购买的细胞存在支原体细菌污染。另外,他说一些研究生可能在实验中太快,没有注意试剂。对此,Winter表示不同意,“我认为这不是科学家们做不出来的原因。”
一位独立于韩春雨实验室工作的中国研究人员向《自然》新闻表示,他的实验室在一些细胞中测试了NgAgo,发现在靶向的位置可以产生基因突变,他说这一结果也通过了测序得到确认。这位科学家补充说,编辑的过程不如CRISPR-Cas9高效,也需要提高效率。“但总的来说,有效,”他告诉《自然》新闻。这位研究人员要求匿名,因为他不想卷入这一争议。
还有另外两位要求匿名的中国科学家向《自然》新闻表示,他们最初的结果显示NgAgo有效,但还需要进一步更多的测序确认。
 “它也许,也许有效,”布尔焦说,“但即使是这样,它也太具有挑战性,不值得去用。它不会超过CRISPR的,很长一段时间内都不会。”
荷兰瓦赫宁恩大学(Wageningen University)的微生物学家约翰·范德欧斯特(John van der Oost)表示,NgAgo的失败“可能令人失望,但是我们还需要看看其他的Ago系统是否可以让它发生作用”。范德欧斯特和合作者也最早证明了Ago家族同源蛋白酶活,两年前发现Ago可以作为一种DNA介导的核酸内切酶。
8月2日,《自然-生物技术》发表声明,“已有若干研究者联系本刊,表示无法重复这项研究“,”将按照既定流程来调查此事”。
《自然》新闻报道称,《自然-生物技术》的一位发言人拒绝透露调查的性质,以及持续时长。
据《人民日报》报道,河北科技大学表示,一个月之内韩春雨将采取适当形式公开验证,届时将有权威第三方作证。
备注:
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阅读《自然》新闻英文报道,请点击文末“阅读原文”:http://www.nature.com/news/replications-ridicule-and-a-recluse-the-controversy-over-ngago-gene-editing-intensifies-1.20387?WT.mc_id=TWT_NatureNews
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