用数据,来辨清事实。
关键词:COVID;突变株;监测
1,新冠疫情主流毒株为EG.5及家族毒株
在全球普遍放开的情况下,新冠的主流毒株也越来越趋向一致。美国和英国尽管也已经取消了全面监测,但仍有持续的数据更新,故对其他国家仍有借鉴意义。

2023年10月13日,美国疾控中心(CDC)更新了美国COVID-19疫情主流毒株的最新变化【1】,显示(比例增加的毒株标记成了红色):
XBB.1.9.2的子代EG.5检出比例达到了23.6%,EG.5的子代HV.119.5%XBB.1.9.1的子代FL.1.5.1出比例为13.5%;这三个毒株也是美国最常检出的毒株。EG.5还有另一个子代HK.3占4.9%,由此XBB.1.9家族合计占检出毒株超61.5%
XBB.1.16检出比例为2.8%,其子代XBB.1.16.1占2.2%、XBB.1.16.6占10.3%XBB.1.16.11占3.1%、XBB.1.16.15占1.8%、HF.1占1.7%由此XBB.1.16家族合计占检出毒株超过21.9%。
XBB.2.3比例为4.1%,其子代GE.1占1.4%。
总体来说,EG.5及其家族构成了主流毒株,但同时新冒出来一堆新的子代突变株;美国的本次报告仍未见BA.2.86的报告(但英国已占2.1%,见下文)
(2023年10月13日更新的美国新冠主流毒株变化。图源:美国CDC)
2,新冠病毒监测显示美国疫情趋于缓和
检测指标中最早反映疫情变化的是废水中新冠病毒浓度和新冠检测阳性率,这两项指标都显示,美国新冠疫情趋于平稳。
废水中新冠病毒浓度持续降低
根据美国废水中新冠病毒监测网站更新到10月2日的数据【2】,从六月底开始持续增高的美国废水新冠病毒浓度
在8月底达到最近半年的高峰640拷贝数/mL,目前
已降低到512拷贝数/mL。

新冠检测阳性率持续降低
与此同时,美国CDC更新到9月30日的数据显示,最近6周美国新冠病毒检出率持续增高(橙线所示),最近一周检出阳性率为10.9%
,较之前一周降低了1.2%【3】。

(美国新冠住院(蓝色柱状图)和检出阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)
3,新冠急诊就诊、住院人数也在降低
根据美国CDC截止到9月30日的数据,美国因新冠去急诊就诊的病例数(橙线)较一周前降低了14.5%;截止到9月30日的数据显示,因新冠感染而住院的人数(蓝色柱状图)较过去一周降低了6%【4】。
4,美国重症新冠患者的三个特点
2023年10月6日,美国CDC公布了美国2023年1-8月住院新冠患者的特点【5】,包括:
1)约2/3(62.9%)的新冠重症患者、绝大多数(87.9%)新冠死亡患者是65或以上的老年人;
2)几乎所有(98.5%)重症患者合并1个或以上的重症高危因素、绝大多数(90.3%)重症新冠患者合并2个或以上高危因素,如糖尿病、肾病、心脏病、肥胖等;
3)发展到重症的老年患者中,
大部分(76.5%)未接种二价疫苗

由此可见,老年人、合并重症风险因素的患者仍需要提高警惕,在疫情高峰期注意通过戴口罩、减少室内聚集等方式降低感染风险;同时及时接种更新疫苗。
之所以即使既往感染且接种疫苗后、
美国CDC
仍建议接种
更新疫苗(针对XBB.1.5毒株)
,主要是由于新冠病毒的持续突变。

英国政府的COVID监控显示【6】,即使只从Omicron突变株算起,目前新冠病毒已经进化到了第14代,其中具有FLip双突变的亚型成为新的主流毒株。
另外,前一阵子在学界掀起巨浪的BA.2.86
终于出现在英国的监测体系内,已经占新建出毒株的2.1%。

FLip突变:
L455F和 F456L突变被称为 FLip 突变,因为它们交换了标记为 F 和 L 的刺突蛋白上两个氨基酸的位置。
曹云龙团队的研究显示,L455F和F456L的组合不仅可以增强逃避能力,还可能增强与ACE2的结合能力!
BA.2.86:
新的Omicron BA.2突变株BA.2.86之所以备受重视,是因为其与目前的XBB.1.5 Spike相差36个氨基酸,相当于是从原始株突变到了Omicron。
但随着研究的深入,越来越多研究显示,与目前主流毒株相比、新冠病毒BA.2.86突变株未有特别强免疫逃逸或者突出的感染力
目前,BA.2.86已在 24 个国家/地区被查到,并呈现出 30-45% 的增长优势,且仍然有可能引发新一波疫情,但不会引发类似Omicron所致全球感染那样的海啸【7】。
美国CDC首次发布BA.2.86 的风险评估摘要:其导致接种疫苗的人群仍可能被感染,但这些药物很可能有效
正是由于这些新的突变,以及美国CDC报告的2023年重症患者的特征,促使美国CDC督促老年人及免疫功能低下的人群及时接种更新的疫苗(2023-2024年度是针对XBB.1.5毒株);一旦确诊,及时口服抗病毒药物预防重症

我们会继续保持关注,提供最新的新冠相关科学报告和数据。
健康长寿,预防是最好的逻辑
参考文献
【1】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions
【2】 https://biobot.io/data/
【3】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_positivity-week
【4】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_new-admissions-rate-county
【5】 https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/72/wr/mm7240a3.htm
【6】 https://www.gov.uk/government/publications/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate-update-11-october-2023
【7】 https://yourlocalepidemiologist.substack.com/p/state-of-affairs-oct-12
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编辑:Henry,微信号:Healsan;加好友请注明理由。助理:ChatGPT
作者简介:美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析、及基于大数据的Hanson临床科研支持主要为医院科研处、生物制药公司和医生科学家提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。
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