Meggie:一款基于MNE-Python的开源M/EEG软件
大家好,我是陈锐。
今天分享内容来源网络整理,内容仅供参考学习分享。
首先祝福大家国庆节快乐。发完这篇文章我就可能就要断更几天了。
在公众号很久之前,我也介绍过一款基于MNE-Python的GUI软件
《MNELAB简介》。总体来说,相比于eeglab来说,使用MNE对于一些学者朋友来说还是有些许难度。这些GUI界面的衍生应该也算是能帮助到些许。
Meggie 是一款开源软件,用于运行 MEG 和 EEG 分析,具有易于使用的图形用户界面。它是用Python 3 编写的,可以在 Linux、macOS 和 Windows 上运行,并使用 MNE-Python 库来完成其数据分析工作。
Meggie 软件试图将复杂的分析方法从 MNE-Python 纯代码带到一个简单的GUI图形用户界面,不需要任何编程经验。
这里至少需要提及三个其它软件:EEGLAB、Brainstorm 和 mnelab。EEGLAB 和 Brainstorm 是成熟的基于 Matlab 的分析软件,具有很好的图形用户界面。mnelab 也是基于 python 的软件。与 Matlab 相比,Python 是免费的,并且具有很强大的可拓展性。与 mnelab 的主要区别在于 mnelab 更忠实于 mne 工作流程,而 Meggie 提供了自己的多被试流程。
Meggie 可以对于单步骤直接进行批量数据处理。例如,在诱发反应的分析中,数据导入、预处理、分段、平均、绘图和保存均可以再多被试中直接批处理。
安装(终端)
Python >= 3.7 、mne>=1.0 和 pyqt5是必需的
来自 PYPI:
- 创建虚拟环境:python -m venv /path/to/meggie-env
- 激活环境:/path/to/meggie-env/bin/activate
- 安装 meggie:python -m pip install meggie
- 启动:meggie
来自 conda-forge:
- 创建一个 conda 环境:conda create -n meggie-env python=3
- 激活环境:conda activate meggie-env
- 安装 meggie:conda install -c conda-forge meggie
- 启动:meggie
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本文作者:陈锐
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