蛋白质是调控生命功能的基本层次，在生命科学研究上具有重要意义，因此受到科研工作重点关注！也是很多小伙伴发文的热点方向！
但由于执行复杂生命功能的蛋白质的结构和功能等的多样性都很高，收录蛋白质信息的数据库往往各有所侧重
。

面对网上一搜，名目繁多的蛋白质数据库，不少小伙伴会无所适从。
那么，我们平时使用的那些常用蛋白数据库，都适合来找一些什么数据呢？
以下，小编选了一些平时常用的蛋白质数据库，整理给大家。
01.Uniprot
网址：https://www.uniprot.org
数据:
各物种基因组测序完成后得到的全基因蛋白质序列，并包含了很多来自文献中的蛋白及其功能信息。
由Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD三大子数据库构成
尤其是Swiss-prot 子数据库，库中蛋白质信息都是手工核对过的 ，非冗余， 有详细注释信息的蛋白数据。
02.Proteinatlas
网址：https://www.proteinatlas.org
数据：
The Human Protein Atlas（人类蛋白质图谱数据库）
基于蛋白组学、转录组学以及系统生物学数据，可以绘制蛋白质图谱的数据库。
免费提供人类编码蛋白信息的公共数据库。
全部24,000种编码人类蛋白质的基因在44个正常组织、18种肿瘤组织、69个细胞系和18种血液细胞的mRNA和蛋白质表达信息。
其结果用高分辨率免疫组化染色图显示，并且由组织学专业人员进行注释。
03.InterPro
网址：https://www.ebi.ac.uk/interpro
数据：
集成的蛋白质结构域和功能位点数据库，包含关于蛋白质家族、域、重复序列、和作用位点等数据资源，
来自不同数据库的诊断签名的人工注释文件，形成了一个给定的蛋白质家族、结构域和功能位点的独特描述。
功能：
提供蛋白序列的功能分析并归纳为一个个蛋白家族。
04.PDB
网址：https://www.rcsb.org
数据：

蛋白质结构的精确坐标数据（三维结构）。这种数据即蛋白质中的原子坐标，是蛋白质结构的最细致的层次。
为了确保PDB资料的完备与权威，各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果提交给PDB。
05.Binding DB
网址：https://www.bindingdb.org/bind/index.jsp
数据：
药物靶点蛋白质和类药小分子之间相互作用亲和力，即非共价结合数据
PDB 相关文献报道数据、专利信息、PubChem BioAssays 数据和ChEMBL 记录数据。
6929 个蛋白靶点和505 999个小分子之间1161912个结合数据。
在拥有亲和力值的蛋白质- 配体晶体复合物中有2291 个蛋白质拥有100% 的序列一致性，5816 个蛋白质拥有85% 的序列一致性。
功能：
药物研发和结合预测模型的构建。
06.String
网址：https://string-db.org
数据：
检索已知蛋白和预测蛋白之间相互作用的数据库。
功能：
生成蛋白质-蛋白质-互相作用(PPI)图
输入蛋白的的分析：功能富集分析(GO、KEGG)等。
07.GeneCards
网址：https://www.genecards.org
数据：
所有已记录的和可预测的人类基因相关的综合全面，且方便使用的信息。
知识库自动集成来自约150个Web来源的聚焦基因的数据，包括基因组、转录组、蛋白质组、遗传、临床和功能信息。
08.GENATLAS
网址：http://geneatlas.roslin.ed.ac.uk/
数据：
综合程度非常高，针对基因和蛋白质进行注释。
录入的基因、表型都具有参考文献支持。
功能：
可检索：基因名称、表型、疾病、基因在染色质的位置。
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撰文丨三叶虫
排版丨三叶虫
编辑丨三叶虫
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