《柳叶刀》子刊:南京医科大陈峰团队在低级别脑胶质瘤预后预测模型取得新突破
为应对高维数据建模的统计方法挑战,提高预测模型的精确性和稳健性,陈峰教授课题组创新构建并应用了3-D分析与建模策略,涉及Double Types of Effects (两种类型效应:同时鉴定具有主效应或交互作用的生物标记物,以提升预测模型的精确性)、Double Steps of Screening (两步筛选信号:发现集校正多重比较一类错误以筛选生物标记物,验证集再次利用独立的跨种族人群予以验证,以确保预测因子的稳健性),Double Steps of Modeling (两步构建模型:训练集构建APOLLO,固定模型所有参数的前提下,在1个内部测试集和4个外部验证集再次评价APOLLO,以确保预测模型的稳健性)。
APOLLO在6个队列中均能够有效区分不同死亡风险的人群(图2 a-f)。进一步,根据APOLLO风险评分的五分位数、90%分位数将患者进行风险等级划分。评分>90%分位数的患者与<20%的患者相比,前者死亡风险是后者的54.18倍(图2 g-h),提示APOLLO具有甄别死亡高危人群的能力。
APOLLO在6个独立队列中均表现出稳健的预测精度(图3 a-f)。综合而言,对低级别脑胶质瘤患者36个月生存的预测精度是0.901 (0.879 - 0.923),60个月生存的预测精度是0.843 (0.815 - 0.871),综合评价指标C指数为0.818 (0.800 - 0.835)(图3 g-i),提示APOLLO预测效果尚可(satisfactory)且稳健(robust)。
为便于实践应用,课题组开发了在线平台(图5):
http://bigdata.njmu.edu.cn/APOLLO/
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本文来源:南京医科大学公共卫生学院陈峰教授课题组,版权属于原作者,仅用于学术分享
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