KM曲线-亚组KM-生存曲线(二分类-数值-单组)
小伙伴们,大家好!又到了小洋专栏的时间。本期小洋将向大家介绍如何利用仙桃学术工具来绘制KM曲线图、亚组KM图、生存曲线(二分类/数值/单组)。
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基本概念
生存曲线(也称Kaplan-Meier 曲线):可以描述各组患者的生存状况或者各组实验动物的存活情况。
累积生存率:多个时间段生存概率的累积。
生存分析的方法:
非参数法:寿命表、Kaplan-Meier(乘积极限法Product limit method)等
半参数法:Cox 回归
参数法
风险比(Hazard Ratio,HR):两个风险率的比值。当HR>1 时,说明研究对象是一个危险因素;当HR<1 时,说明研究对象是一个保护因素;当HR=1时,说明研究对象对生存时间不起作用。
Overall Survival(OS):总体生存期,指结局指标是死亡时间,这个死亡是任何原因导致的死亡都算进去,只关心是否死亡,不关心因为何种原因死亡。这个指标能比较方便的记录,因为患者死亡的日期确认没有困难。只要研究结果显示生存有提高,就可认为是临床有获益。但所需要的随访的时间较长。
Disease Free Survival(DFS):无病生存期,指经过治疗后未发现肿瘤,结局指标为疾病复发或死亡,同样不需要关心死亡原因。这一指标是临床获益的重要反映,随访时间可以缩短,因为增加了疾病复发这一节点。没有复发或没有死亡同样可以反映临床获益。这里也涉及到无疾病复发的一个定义,因此在临床资料纳入上比较困难。
PFI 无进展间隔:progression-free interval,从初次治疗的随机分组日期到疾病复发时间。
应用场景
生存曲线:主要用于描述受试或者研究对象在一段时间内发生事件(存活or 死亡/是否复发等)的情况。
亚组生存曲线:亚组是相对于整体而言,即在一小群体中查看变量的预后价值。若选择了所有的亚组,则此时基本等同于在总体中进行分析,所以不能选择所有亚组进行分析。
注意:这里的亚组KM 图,是单独在亚组里面中再对分子进行分组。
结果解读
 KM曲线图 
  • 生存曲线的横坐标是观察时间,纵坐标一般是生存率。曲线上的每一个点代表了在该时间点上病人的生存率。
  • 在坐标轴(0,1)点上,由于才开始随访(X 轴为0),此时没有患者死亡,所以两组患者的生存率都是1(100%)。
  • 曲线下降越缓慢,预后越好。
  • 曲线上的“+”用于标识删失数据。
 亚组KM图 
  • 生存曲线的横坐标是观察时间,纵坐标一般是生存率。曲线上的每一个点代表了在该时间点上病人的生存率。
  • 在坐标轴(0,1)点上,由于才开始随访(X 轴为0),此时没有患者死亡,所以两组患者的生存率都是1(100%)。
  • 曲线下降越缓慢,预后越好。
  • 曲线上的“+”用于标识删失数据。
  • 主标题代表在哪个亚组中,如上图代表在WHO 分级为G3 的亚组中,ERBB2高表达组预后差。
 生存曲线-二分类/数值/单组 
  • 生存曲线的横坐标是观察时间,纵坐标一般是生存率。曲线上的每一个点代表了在该时间点上病人的生存率。
  • 在坐标轴(0,1)点上,由于才开始随访(X 轴为0),此时没有患者死亡,所以两组患者的生存率都是1(100%)。
  • 代表女性的蓝色曲线始终在代表男性的红色曲线上方,表明在同一时间节点上,女性存活率较男性存活率高,女性这个因素预后更佳。
  • 曲线上的“+”用于标识删失数据。
以上就是有关KM曲线图、亚组KM图、生存曲线(二分类/数值/单组)的背景介绍,如果想要进一步掌握更多的相关内容,还可以登录解螺旋官方网站进行深入的学习和探索!
实战演练
下面让我们来看一篇2020年3月发表在“Clinical and translational medicineIF= 11.492)杂志上的一篇文章。题名为“Calreticulin couples with immune checkpoints in pancreatic cancer”。
期刊简介
使用工具
仙桃学术(https://www.xiantao.love
图形复现
 KM曲线图 
进入仙桃学术,点击【生信工具】
【高级版】 → 【立即使用】
【临床意义(靠)】 → 【预后分析】 →【(云)KM曲线图】→选择胰腺癌→输入TNFRSF14分子→确认
保存结果
 亚组KM曲线图 
【临床意义(靠)】 → 【预后分析】 →【(云)亚组KM曲线图】→选择胰腺癌→输入TNFRSF14分子→选择亚组:临床参数Age,分组Age>65→确认
保存结果:
 生存曲线(二分类/数值/单组)
【基础绘图】 → 【生存曲线(二分类/数值/单组)】 →上传数据→确认
我们模拟一份数据,然后进行绘图:
上面的数据是模拟数据,不过我们主要掌握方法即可。上传数据后,点击“确认”进行绘图,并保存结果。
好啦,本期有关KM曲线图、亚组KM图、生存曲线(二分类/数值/单组)的相关内容就介绍到这里,希望对大家的科研工作有所帮助。我是小洋,我们下期再见~
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END

撰文丨小   洋
排版丨四金兄
主编丨小雪球
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