期待已久的炫酷和线图，今天终于可以学到了！
小伙伴们，大家好！又到了小洋说图的时间，不知道上期的nomogram图大家学会了嘛？这一期，小洋继续向大家介绍一款在生信文章中经常出现的图形——和弦图。
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基本概念
和弦图（Chord 图，相关性圆圈图）
把一整个圆环按照每个变量对应的相关性总和分成对应的块，每个块之间用条带连接，条带的粗细和颜色的深浅代表相关性大小，是展示几个或者十几个变量之间相关性情况的一种可视化方式。
应用场景
主要用于可视化几个或者十几个变量之间的相关性情况。
结果解读
图上一共有6 个色块，分别对应6 个分子，每个色块总的长度由这个分子对应的相关系数的总和决定（条带（相关性）宽度总和）。
  • 如果一个分子和其他分子的相关性系数都很大，则这个分子的色块总长会相对比较长。
色块和色块之间的条带联系代表这两个分子之间的相关关系，相关性（绝对值）越大，条带越宽。条带连接在色块上的刻度就代表对应相关系数绝对值的大小。
  • 如果两个分子之间的条带比较宽，则说明这两个分子之间相关系数比较大。
除了宽度外，条带的颜色深浅和代表相关系数的大小。其中越蓝色则代表负相关程度越大，越红色则代表正相关程度越大。
备注：上述所说的相关指Spearman 相关或者Pearson 相关
以上就是有关和弦图的背景介绍，如果想要进一步掌握和弦图的相关内容，还可以登录解螺旋官方网站进行深入的学习和探索！
文献解读
以上就是有关和弦图的背景介绍，如果想要进一步掌握和弦图的相关内容，还可以登录解螺旋官方网站进行深入的学习和探索！
下面让我们来看一篇2020年11月发表在“Frontiers in Immunology（IF= 7.561）杂志上的一篇文章。题名为“Molecular and Clinical Characterization of PD-1 in Breast Cancer Using Large-Scale Transcriptome Data”。
期刊简介
复现工具
仙桃学术工具（https://www.xiantao.love/products）
图形复现
进入仙桃学术，点击【生信工具】
【高级版】 → 【立即使用】
【交互网络（联）】 → 【相关性可视化】 →【和弦图】→上传数据→确认
我们参考文献中的和弦图，模拟一份数据，然后进行绘图：
上面的数据是模拟数据，所以并不会和文献中的图片完全一致。不过复现我们主要掌握方法即可，不需要完全复现。上传数据后，点击“确认”进行绘图，并保存结果。
好啦，本期有关和弦图的相关内容就介绍到这里，希望对大家的科研工作有所帮助。我是小洋，我们下期再见~
欢迎大家关注解螺旋生信频道-挑圈联靠公号~
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撰文丨小   洋
排版丨四金兄
主编丨小雪球
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