大家周末快乐吖,咱今天八卦另外一种变异毒株吧。
南非特产C.1.2,这周刚刚挤掉Mu,晋升成为新冠病毒免疫逃逸能力TOP 1
但似乎国内媒体没太关注这条信息?
当然也有可能是因为C.1.2的瓜,国内媒体在一个多月之前就吃过了……

——请品鉴:
不过吧,《观网》这篇文章,各位没必要专门挖坟出来看,基本全是错的,摊手~
准确信息还是看咱这边吧。
一、C.1.2生平
C.1.2最早的测序记录于2021年3月份现身南非豪登省(约堡所在的那个省)。
划重点啊,不是WHO说的5月份,也不是南非卫生部说的6月份。这货3月份就有了~

——突变位点请品鉴:
刺突蛋白这密密麻麻一大堆……而且几乎全是阴间突变……
就问各位怕不怕吧~
所以很顺理成章地,这货登上了WHO的WUM(监控中的变异毒株)排行榜,

——请品鉴:
↑ 顺便一提,这个榜单的最新入围选手B.1.630,咱前几天刚刚八卦过,正好还跟C.1.2长得几分神似,见这里
二、C.1.2中国游
关于C.1.2这货,刚好咱还是有点发言权的…
7月13日,深圳CDC上传了这个毒株的测序记录
——请品鉴:
(顺便吐句槽啊,当初深圳市WJW多次号称6月份约堡飞深圳那架CA868航班上那30多个感染者全是Delta,却暗搓搓地把C.1.2的测序记录上传GISAID,简直捉摸不透…)
总之,因为留意到深圳CDC上传的序列,我们这边7月19日提交过关于这货的新毒株报告
结果交上去才发现,英格兰卫生署的道友们7月9日就捷足先登了(因为这货6月29日就现身英国了)……

——请品鉴:
害,还出了个不大不小的糗……
然而,身为第一事故现场的南非,当时本土都好几十例了,还跟无事发生一样,就尼玛离谱……
三、茫茫多的突变
根据英格兰卫生署道友们的资料,咱一眼就看得出来,C.1.2这货的突变程度明显要高于同辈,

——请品鉴:
↑ 如上图,黄色高亮部分是C.1.2的演化树,距离圆心越远,则代表与原始株的差异程度(divergence)越大。

——或者咱换成南非卫生部的图看起来更清楚:
↑ 位于两点钟方向紫色的C.1.2简直无情,远远甩开了屈居第二的Mu=B.1.621,更甩开了四大VOC。
这也就是为啥当初《观网》要说C.1.2“突变速率是Delta的两倍”(错误的说法!
因为这货的突变位点真的很夸张。
四、免疫逃逸界新晋扛把子
话说这周新鲜出炉了一篇预印本,
——请品鉴:

标题:
使用各种疫苗接种产生的抗体(部分接种者曾有既往感染史)对C.1.2和Mu变异毒株的中和试验
——一句话总结,试验结果如下:
红色高亮部分简单翻译:
带有C.1.2刺突蛋白的假病毒,对中和抗体的抵抗力强于所有VOC。
——或者咱仔细瞅瞅数据呗:
↑ 上图从左到右四个突变分别是康复者血清、BNT疫苗接种后产生的抗体、Moderna疫苗接种后产生的抗体,以及强生疫苗接种后产生的抗体。
每个图表的纵轴是半数最大中和滴度(IC50),横轴则是各个毒株(B.1、Beta、Delta、额外加了N501S突变的Delta、Mu以及C.1.2)。
试验结果一目了然:针对康复者血清以及三种疫苗,C.1.2相对B.1的IC50降幅如下:
  • 康复者血清下降
    7.8倍

  • BNT疫苗下降
    7.3倍

  • moderna疫苗下降
    8.8倍

  • 强生疫苗下降15.7倍
作为对比,
  • 上一代扛把子Mu的战绩分别为4.7倍、6.8倍、5.8倍和8.8倍;
  • 上上一代扛把子Beta的战绩则是4.4倍、4.8倍、3.9倍和7.6倍。
所以免疫逃逸top 1这个称号,Mu从Beta手里接过来不到1个月,就被C.1.2给撬走了
病毒太尼玛内卷了……

并且吧,纽约大学这组中和抗体试验选用的C.1.2,还是当初7月份英格兰卫生署提交的那个版本。
距离现在已经三个多月了,C.1.2也是会演化的……
甚至演化速率还比杂牌毒株们高很大一截~
现如今的C.1.2,比三个月之前又额外多出了Delta同款的T478K~
——请品鉴:
……

惊不惊喜意不意外?
五、关于C.1.2,最大的焦虑

我们现在已经知道,免疫逃逸并不是变异毒株最核心的竞争力,核心竞争力始终是传染性。
我们现在又已经知道,在疫情早期,免疫逃逸能力和传染性还是不可兼得的属性(比如说Beta),但到了现在,病毒们已经完全可以两手抓两手都硬了(比如说传染性暂列第二的Mu)~具体可以见这里
那么C.1.2的传染性到底怎么样呢?
——请品鉴:
↑ 以上是比利时鲁汶大学Tom Wenseleers老师的南非各毒株流行率相对增长率多项式曲线拟合模型。
根据截止7月底的数据,在Delta已然占据当地主流毒株地位的情况下,C.1.2流行率相对增长率仅比Delta低每天2%~
考虑到置信区间的话,谁快谁慢都还两说……
或者横向比较的话,当初以增速迅猛出名的Mu,在主场哥伦比亚,流行率相对增长率比Delta低每天10%……
并且吧,事实往往比预想的更糟糕~
没想到当初预测Delta走势一举成功的Wenseleers老师,这一回也失手了……
C.1.2在南非的实际增长率,是这样的~
——请品鉴:
↑ 以上蓝色曲线是以采样日期(即核酸检测日期)计算的流行率增长曲线(2021年3月起,截止2021年9月底);橘色曲线则是以提交日期(即把测序结果上传到GISAID数据库的日期)计算的流行率增长曲线(2021年6月起,截止2021年10月23日)
由于南非测序和上传工作效率感人,所以这两条曲线略有差别,
但不管哪一条,都在切切实实地增长
换句话说就是——
C.1.2是目前市面上唯一一种在Delta占据主流毒株地位的前提下仍然保持增长的毒株。
各位你们可以开始焦虑了……
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