上集见这里：[变异毒株]Delta时代的那些非Delta余孽们（上集）

话说，昨天咱简单八卦了一下VOC（受关注变异株）的三朵过气黄花。
简单回顾一下：
其中Alpha和Gamma还勉强保存了一丢丢日渐萎缩的大本营，
而Beta已然进入流窜作案、零星散发状态，
完全没有了当年四分天下的王霸之气。
但哪怕已经被后浪推前浪，
前浪却拒绝死在沙滩上。
刚好相反，Alpha和Beta各自经历了武林奇遇，
并且洗出了亲妈不认的魔改版本。
今天咱继续品鉴英国卫生安全局《第28期英格兰地区新冠病毒VOC/VUI技术简报》的9种VUI（正在调查的变异株）。
分别是：

  • AY.4.2（Delta徒子徒孙之一）

  • B.1.525（Eta）

  • B.1.617.1（Kappa）

  • B.1.621（Mu）

  • P.2（Zeta）
  • P.3（Theta）
  • B.1.617.3

  • AV.1

  • B.1.1.318
对了，大伙儿会不会觉着上面那堆代号……就跟天书一样？
咱这就插播一个关于变异株名称的名词解释啊。
各位已经知道，新冠病毒的变异毒株层出不穷，
WHO搞的希腊字母命名法完全不够用的……
所以业界一般还是习惯用pango命名法。


用人话来说，pango命名法通常由从左到右3-4个小节组成，
每两个小节中间由分割符"."进行区分。
其中第一个小节是大写字母（一位字母或两位字母都可以），比如说B.1.1.7，或者AY.4.2；
后面几节则全部是数字。
从左到右每个小节，都对应演化树上的一次进化枝分化，
（可以类比初中学的“界门纲目科属种”不断细分）
以“”B.1.617.2”为例，
其中最左边的“B”，代表新冠病毒的B进化枝（当初武汉两种初始毒株之一）；

“B.1”则代表B进化枝下的第一个分支；

然后“B.1.617”代表B.1进化枝下的第617个分支；

再然后，“B.1.617.2”代表B.1.617进化枝下的第2个分支。
在变异株名称长度达到4个小节之后，Pango team的老师会约定一个新的专属英文简称，用来专门指代上述4个小节。

比如AY.4.2里边的"AY"，指代的就是"B.1.617.2"这4个小节。
所以AY.4.2的意思，就是“B.1.617.2.4.2”。

（或者说，AY.4.2相对于原始株而言，演化树已经分支了6次）

——一图秒懂，请品鉴：
回到主题，
关于《技术简报》里边9种上榜VUI，
一句话总结如下：
  • AY.4.2是Delta家族最耀眼的当红新星；
  • Mu是当前新冠病毒江湖仅次于Delta的六边形全能战士（可惜照样不太挡得住Delta的蚕食）；
  • B.1.1.318是被WHO忽略的实力派干将（可惜还是挡不住Delta的猛攻）；
  • 其他六位……则全都是已经过气但暂时没有死在沙滩上的前浪~
说到前浪后浪推前浪，
现如今的《技术简报》清单，其实非常形象地说明了新冠病毒演化至今已经发生的一种范式转换：
  • 在前Delta时代，某种变异株是否牛鼻，需要从多维度评估，比如突变位点吓不吓人、传染性高不高、毒力猛不猛、免疫逃逸强不强，等等；
  • 而在Delta一桶浆糊的现在，判断变异株是否牛鼻的标准已经异常简洁且同质化——只要能继续苟活，不被Delta完全拍死在沙滩上，就是牛鼻，就是强。
下面就一一简单点评几句吧~

B.1.525（Zeta）
这货大概在2020年7月份首次现身尼日利亚。

2021年3月底到达流行率顶峰，约占全球1%的样子~
主要流行范围是以尼日利亚为中心的中部非洲地区，以及美国加拿大；
其中在苏丹实现了超过五成的市占率。
——请品鉴：
这货之所以能喜提WHO专属希腊字母，
主要原因是曾经和B.1.526并称为“纽约变异株”，
共同主导了名噪一时的纽约大爆发~
——请品鉴：
2021年4月份之后，这货逐渐被Delta取代，
现如今只剩零星散发。
WHO专属希腊字母称号也被收回了……

最后一次现身是2021年9月20日（在荷兰）。
B.1.617.1（Kappa）和B.1.617.3
毫无存在感的变异株。
出现的时间不明，盲猜和Delta同时期（吧）……
毕竟印度测序能力感人，搞不明白才是正常情况
入围《技术简报》和喜提WHO专属希腊字母的主要原因，则在于沾了亲兄弟Delta的光……
其中Kappa还勉强有一次拿得出手的爆发记录，也就是2021年5月份导致墨尔本封城两周的那次~
结果被墨尔本超神发挥，反手就给它摁没了，毫无悬念……

——请品鉴：
B.1.617.3则更是默默无闻，毫无亮点。
这两兄弟最后现身都是2021年9月中旬（印度和英国都有）。
哦对了，B.1.617.1的专属希腊字母也惨遭回收了~
P.2
同样从头到尾都毫无存在感的变异株，同样是希腊字母称号惨遭剥夺的弱鸡。
入围《技术简报》和喜提WHO专属希腊字母的主要原因，照例是沾了亲兄弟P.1（Gamma）的光……
最后一次现身是2021年10月6日（美国佛罗里达州）。

P.3
2021年1月底被日本入境检疫机构挡获，来源于菲律宾。
由于长相和同样被日本入境检疫机构挡获的P.1（Gamma）太神似，所以备受重视，
毕竟趋同演化这种事情不是啥好兆头……
但P.3的实际战力似乎差了Gamma几条街~
不过也说不定，
毕竟菲律宾测序工作太一言难尽，所以我们其实并不知道这货在菲律宾境内到底流行到了什么程度，以及现在还有没有继续存活~
另外这货它就是个入境检疫惯犯……
时不时就要在日本/韩国/香港/新加坡等入境检疫刷个存在感~

（这也侧面说明了，菲律宾的主要支柱产业，就是劳务输出
）
最后一次现身是2021年9月初（日本入境检疫）。

AV.1
不要跟AY.1搞混了……
AY.1是Delta家族的长子长孙（虽然现在看起来挺挫），
而AV.1的全称则是B.1.1.482.1。
这货2021年3月底诞生于英国，
跟上面的P.2、P.3一样，这货完全没有实际战绩，
入围《技术简报》纯粹是因为突变位点看着太唬人，
特别是刺突蛋白部分（打红框的就是看着唬人的部分）~
——请品鉴：
没办法，那时候大伙儿被Beta和Gamma吓破了胆，看到E484K就瑟瑟发抖……
现在这货最大的存在意义，就是作为一个负面典型，
教育刚刚开始跟进变异株演化的postdoc们：
满身阴间突变并不一定厉害，
决定变异株威胁程度的唯一标准，还得看实践检验
AV.1最后一次现身是2021年7月份（在贝宁）
B.1.1.318
简单来说，B.1.1.318是整个VUI清单上仅次于AY.4.2和Mu的强悍存在，
但不知为啥从来没有混到WHO专属希腊字母，

可见WHO是多么地后知后觉……

B.1.1.318于2021年1月初诞生于尼日利亚（又是尼日利亚），
之后顶着当时的全球扛把子Alpha，
陆续抢到了毛里求斯、乌干达、希腊等好几个国家/地区的堂口，
并且直到7月中旬，都有能力在少数地区跟元祖版Delta正面拉锯~

——请品鉴下面这张经典老图：
↑ 上图是荷兰乌特勒支大学Henk-Jan Westeneng老师搞的希腊各变异毒株流行率增长速度多项式拟合（截止2021年7月15日）。
其中，中间的标杆（黑色虚线）是Alpha，
（一代扛把子沦为背景板……）
其他毒株则用黑点表示。黑点上面的黑色线段代表了置信区间，
黑点越靠右，则意味着该毒株相对于alpha的流行率增长率越高。
7月份的希腊，可能是Delta吃瘪最惨的场合……连前三都没挤进去
哦对了，上图排名第二的Other其实就是B.1.1.318的子毒株AZ.2~

Westeneng老师是搞算法的，毒株分类他不太熟，没认出来，
所以一不小心闹了个小笑话，大伙儿请别在意。
总之，正因为B.1.1.318实力不俗，
所以子孙也比较繁茂，一共7个，
——请品鉴：
虽然跟接近200个后代的Delta没法比，
或者跟20个后代的Gamma相比也有点差距，

但至少已经是Alpha/Beta的水准了。
故事的结局，B.1.1.318在多个地区刚住了元祖版Delta，
但很快就被更高更快更强的徒子徒孙版Delta推到了沙滩上……
（同样的故事在全球多个地区上演）
只剩下AZ.5（毛里求斯子毒株）一根独苗，
最近刚刚入围WHO的VUM（正在监测的变异株）清单。

不过AZ.5之所以能幸免于难，主要还是因为命好，生在毛里求斯~
毛里求斯啥地方？
全非洲防疫top 2，防疫水平甩了非洲平均水平8条街，甩了英美欧28条街。
——请品鉴：
但虽然身为非洲top2，
毛里求斯还是力有不逮，没法实现社区感染快速清零，
只能一边慢慢解决AZ.5，一边尽量延缓Delta入侵。
结果AZ.5没摁死，Delta的输入和传播又受到限制，
这就相当于阴差阳错，变相保护了本该被Delta长江后浪推前浪的AZ.5……
最终结果就是AZ.5继续在毛里求斯苟活……
至于说突变，AZ.5的突变大致是这么个造型~
——请品鉴：
比原始版B.1.1.318多出了十几个突变，
其中刺突蛋白部分如下：
D80Y+A243S+W258L+T859I；
基本上可以说是亲妈不认识了……
但比起《技术简报》上藏身于最后一部分的几个大怪物还是有不少差距。
所以估计这一脉的命运差不多就这样到头了（吧）
最后，还剩下Mu和AY.4.2两个大魔头，之前已经专门八卦过了~
见这里：
[变异毒株]关于μ（B.1.621）的一些八卦
以及这里：[变异毒株]Delta家族最新动态，AY.4.2特别篇（2021年10月20日更新）
所以就不再重复了。
只简单更新一点最新情况。
其中Mu在南美洲大本营勉强守住了基本盘~
——请品鉴：
AY.4.2则更是在英国稳步扩张，

——请品鉴：
最近甚至还开枝散叶，搞出了后浪AY.4.2.1……
当然了，大伙儿都明白一个浅显道理，
层出不穷的病毒变异，
归根结底，源自于宿主们的无私供奉~

所以Mu所在的南美和AY.4.2所在的英国，可想而知……前景都不太妙~
——比如说，英国：
——南美（以智利为例，其他地方的曲线才刚刚抬头）：
↑ 请注意纵轴的坐标系魔法
所以情况就是这么个情况啦，
但凡自己躺平拉胯，
就别怪病毒变异凶猛~
一切都是活JB该。
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关键词
变异株
AY.4.2
变异毒株
B.1
新冠病毒