今天咱来八卦一个已经灭绝掉的变异毒株吧——

编号刚好比Delta(B.1.617)大一号的B.1.616,
2021年1月29日,这货首次现身法国布列塔尼地区某医院(院感),并且后来蔓延到了当地某养老院。所以当时的新闻报道称之为“布列塔尼变异株”……
——请品鉴:

法国卫生部长:“初步分析显示,新毒株并不比其他毒株毒力更高或传染性更猛……”
(官方撒谎最为致命)
现在我们已经知道,B.1.616总共测序出了41例。
法国巴斯德研究所的Etienne Simon-Loriere老师于2021年3月13日发现该毒株并提交,
(然后各大媒体3月16日就开始争相报道了,狗鼻子可真灵……)
由于巴斯德研究所及时发现,且准确意识到了这货的凶险,通过严防死守,这货在2021年4月23日之后彻底销声匿迹。
(万幸!)

虽然来得快去得也快,但凭着区区41条测序记录就赚到一条Pango专属命名编号,显然有非凡之处。
(顺便吐个槽,现如今好几百条甚至上千条测序记录都不一定能分配到编号……变异毒株也要搞通货膨胀么!)

那么B.1.616的非凡之处是啥呢?
——请品鉴:
第一:一出世就顶着全神戒备的巴斯德研究所制造了百人规模的院感事件,
传染性
显然十分了得(虽然法国卫生部长硬着头皮说“没有证据证明这货传染性更厉害”……);

第二:
PCR检测逃逸
……初检灵敏度只有
15%
可还行?

第三:残暴的毒力……重症率65%,28天内病死率46%(所以部长大人您脸疼不?)
简单来说,B.1.616的突变位点如下:
一共29个突变位点
以2021年初的标准而言,这完全算得上变异得到亲妈不认了……

——比如说,对比一下同期其他变异株呗:

整整29个……这是要笑傲浆糊啊~
其中,10个刺突蛋白突变如下:
H66D、G142V、144del、D215G、V483A、D614G、H655Y、G669S、Q949R、N1187D
一方面数量茫茫多,
另一方面呢,除了144del、D215G、D614G和H655Y之外,其他都是在当时几乎没露过面的全新突变(现在也算得上少见)~
而已经露过面的那几个突变里面,144del是Alpha同款、D215G是Beta同款、H655Y则是Gamma同款……个个都堪称凶险。

于是针对B.1.616,巴斯德研究所搞了一个小型的对照研究,
不过由于是一边治疗和防疫一边搞study,细节方面可能没法太讲究……
  • 比如说B.1.616组和对照组的年龄相差了8岁,性别、种族和基础病等方面显然也没法太强求,只能靠后期大力搞normalization了……

  • 再比如说B.1.616组的病例居然没有全部PCR检测阳性(因为这货有逃逸检测的恶心本领,各位懂的)……
  • 以及两个对照组吧,一个是Alpha+Beta+Gamma三种毒株组成的VOC组,另外一个居然是“不知道到底是啥毒株”组……
——总之,巴斯德研究所的对照研究结果如下:

39个病例,14个(36%)进ICU,27个(65%)重症,18个(46%)挂掉。
作为对比,VOC组才挂了16%而已……
下面来一点主观盲猜哇~

从突变位点的蛛丝马迹来看(比如说S:V483A),这货有可能源自免疫抑制+长期感染,
这刚好能够解释为啥一上来就是院感,也能够解释为啥这货早在2021年初就集齐了29个突变。
而且吧,法国正好就是免疫抑制患者催生阴间变异株的重灾区之一,
比如后来的
Q.7
,多半就是同样的来历……

——请品鉴:
在Alpha的基础上,Q.7的刺突蛋白额外多出了A163V、M177T、P251L、L303F、V308L、Y449H、N460K以及G485V,整整8个突变……
并,这次再也没有当初B.1.616那种好运了。

Q.7从4月份开始社区传播,直到现在都还没被Delta剿灭~
最后,关于免疫抑制+持续感染制造超强变异株的风险,可以参考这里
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