再推荐1个更新较快的网络药理学相关数据库
【SymMap】
(网址:https://www.symmap.org/)
图片来源于SymMap
SymMap提供了大量关于中药、中医症状、西医症状、化合物、靶点和疾病的信息,包括在中国药典中注册的499种中药,含19595种化合物以及1717种中医症状。此外,SymMap收集了这些中药/化合物相关的4302个靶标和5235种疾病。它通过直接或间接关联统计推断所有类型元素之间的成对关系并显示它们的综合关系网络。
从“Browse”中点击进入,用户可以浏览所有草药、中医症状、西医症状、化合物、靶点和疾病,并通过点击SymMap ID详细查看某一项的分类信息和网络图。
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点击“Search”,可以搜索中药、中医症状、西医症状、化合物、靶点和疾病。比如输入“qinghao”,下方显示青蒿的ID、中文名、拼音、拉丁名、英文名和中药分类等。
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点击“Herb id”进入详细页面查看,SymMap已构建好六个元素间的互作网络。网络中的每个节点都可以移动,点击可打开对应节点的信息网页,网络图可以设置p值进行筛选,图片和表格均可下载。SymMap链接到TCM-ID、TCMID和TCMSP数据库,可以点击查看其他数据库的信息。
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如果我们需要下载网站所有信息,可以点击“Download”,SymMap提供6类元素所有的下载信息,大家可以下载下来,综合其他的数据库进行筛选。
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好用的数据库不少,都能够帮助大家从中药及其天然化合物中挖掘与靶点或疾病的关系,结合Cytoscape等寻找关键子网络,后期可加上一点分子生物学的验证,就是一篇比较完整的网络药理学文章了。
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