Kaplan-Meier生存曲线(包括统计检验、95%Cl)的简介与绘制(不用R软件)
平均阅读时长为 2分钟
肿瘤专业的小伙伴(当然不止)一定经常用到生存曲线,1928年生存曲线(又称存活曲线)首次由美国生物学家雷蒙·普尔提出,它可以反映不同种群在每个年龄段生存的数目。
1958年,Edward L. Kaplan和Paul Meier也首次在临床研究中提出了生存曲线的概念,又被称作 Kaplan-Meier曲线,主要用来对各组患者的生存状况进行描述。
本次推文简单介绍不用R软件如何绘制Kaplan-Meier 曲线并作统计分析和95%Cl。
首先介绍下Graphpad Prism软件如何操作:
1.打开软件,survival 模块下, 选择 use sample data (Graphpad Prism5.0,更新的版本也类似)及2组数据。需要用自己的数据可以对应修改。2.点击 ok 后出现下图 data 数据,X 轴代表天数,Y1、2 分别用 0 和 1 表示,1 代表死亡;0 代表存活。(自己的数据可以对应修改即可,当然也可以在上面第一步选择start with a n empty data table)
3.数据填充好了后,下一步就是进行数据分析了:点击 results 模块下的 survival of two groups,生成下图的分析结果:
上图中:①Log rank检验:进行两组或多组生存曲线的比较,检验统计量在大样本时近似服从X2分布自由度为分组数-1;②Log rank趋势检验;③Breslow:检验生存分布是否相同,以各时间点的观察例数为权重;④Y轴的表现形式:有percent survival/death和fraction survival/death四种选择。
5. 统计分析结果出来了,最后一步就是作图了:选择 graphs 模块,按下图进行选择。点击creat后草图形成,如下图。然后按照个人习惯调整曲线的颜色、样式以及粗细。
最终我们获得如下Figure:
此外,有时需要添加95%Cl,可点击此处:
但最终获得的效果图似乎不是很清楚:
别急,下面还将
推荐两个网站来绘制生存曲线,直接生成Figure。
1.https://hiplot.com.cn/
1.1找到生存分析
1.2输入数据(以DEMO为例):
1.3提交数据即可获得如下Figure:
2.http://www.bioinformatics.com.cn/
2.1找到生存曲线
1.2输入数据(以DEMO为例):
1.3点击参数选项后提交数据即可获得如下Figure:
以上几种方式不用R语言软件即可获得K-M生存曲线,你学会了吗?大家可以根据自己喜好选择适合自己的生存图。
【加入中医药交流群】添加小编微信邀请加入,也可由群友邀请加入,欢迎广大老师、朋友加入我们。
小编微信:
【往期推荐】
上中医/第二军医大/中医科学院:系统药理学研究阐明清肺排毒汤治疗新冠肺炎保护机制
2021-01-24
施一公教授眼中的饶毅:赤子情怀、童心未泯...
2021-01-23
Graphic abstract如何设计与绘制—以中药复方药理为例简单讲讲
2021-01-22
新药研发流程及研发项目管理时间轴
2021-01-22
【中药单体受欢迎-药学2区-年刊450+】芹菜素体外抑制多发性骨髓瘤及iNOS/COX-2相关机制研究
2021-01-20
【天然产物可投-中科院1区-IF近10】南京中医药大学:姜黄素减轻肝纤维化的作用机制
2021-01-18
诺华视频Drug discovery:从药物研发到上市过程
2021-01-18
【年刊近800-Q1分区】暨南大学:基于网络药理学探讨柴胡疏肝散经核受体对非酒精性脂肪肝大鼠的影响
2021-01-16
用Graphpad软件绘制ROC曲线!
2021-01-15
高分文章(IF7.0以上)Figure是如何作的——生存曲线、体重变化及柱状图
2021-01-07
最新评论
推荐文章
作者最新文章
你可能感兴趣的文章
Copyright Disclaimer: The copyright of contents (including texts, images, videos and audios) posted above belong to the User who shared or the third-party website which the User shared from. If you found your copyright have been infringed, please send a DMCA takedown notice to [email protected]. For more detail of the source, please click on the button "Read Original Post" below. For other communications, please send to [email protected].
版权声明:以上内容为用户推荐收藏至CareerEngine平台,其内容(含文字、图片、视频、音频等)及知识版权均属用户或用户转发自的第三方网站,如涉嫌侵权,请通知[email protected]进行信息删除。如需查看信息来源,请点击“查看原文”。如需洽谈其它事宜,请联系[email protected]。
版权声明:以上内容为用户推荐收藏至CareerEngine平台,其内容(含文字、图片、视频、音频等)及知识版权均属用户或用户转发自的第三方网站,如涉嫌侵权,请通知[email protected]进行信息删除。如需查看信息来源,请点击“查看原文”。如需洽谈其它事宜,请联系[email protected]。