WES再发力,10分+肿瘤文章研究全靠它!
全外显子组测序( whole exome sequencing, WES 或WXS)可以一次性分析得到疾病(肿瘤)等的SNV、 INDEL、 CNV、 SV、 FUSION等变异。
优势:
① WES分析又容易又快,还可获取更好质量的数据;
② 多个数据库联合;
③ 灵活合并数据并分析。
然而,利用WES数据发表文章需要一定的编程基础和会使用多个数据库。瞬间唉声叹气中:唉,还是放弃吧!
为解决大家的困境,解螺旋推出了《WES在肿瘤研究中的应用》课程,旨在帮助大家更快的了解并掌握利用WES数据发表文章的套路和技巧,快速上手代码编写!!!
课程主要包括以下四个方面:从9种WES套路解读到文章框架构建,从数据细化结构到数据作图与文章复现,一站式完成所有动作,奔向SCI的大门。
1. 研究套路与文章框架
2. 文章数据精细化解构
3. 数据作图与文章复现
4. WES相关数据库使用
首先,介绍WES优势;分析WES套路;介绍TMB数据及其处理;构建文章框架。
①展示WES的优势和样品准备;WES产生VCF的过程;让大家对WES有个感性的认识。
②通过9篇WES文章套路分析,让大家知道WES发文的标准模式。
③从通过影响TMB准确定的因素到体细胞突变,从注释软件应用到TMB计算方法;从WS和panel的TMB一致性研究到靠谱的TMB筛选;
从TCGA数据库TMB分布到通用研究设计思路。使大家更好更全面的认识TMB数据,并了解TMB数据的处理;并从整体上掌握WES分析流程及发文套路。快速补给WES基础知识和常识。
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第二,根据酸菜大大总结的【挑圈联靠】进行文章数据精细化解构。在这部分课程中,通过言简意赅且通俗易懂的方式详细讲解每个图表所要讲述的故事。
第三,数据作图与文章复现 此处有代码----不怕不怕,实操一步到位,不用再看其他教程。课程中完整细致R代码带你一步步读懂代码,体验敲出代码的乐趣,写出自己文章的成就!
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第四,至此,大家对WES已经有了更深层次的理解了。但加餐怎可少。课程还对WES相关数据库做了总结并展示比较好用的一些数据库。
总结,本课程不仅揭示了经典文献WES套路;精细结构、完整细致R代码讲解&复现文献;并且全流程、无死角覆盖WES的整个分析流程。
课程用保姆式的教学方式教大家发表自己的WES文章,值得拥有哟!!!
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《WES在肿瘤研究中的应用》
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