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抗菌药物耐药性（AMR）的出现和传播对人类和动物的健康而言是一个灾难性的问题。预计到2050年，其造成的死亡人数将超过癌症。Microbiome, Environmental Microbiome 和 Animal Microbiome 将联合推出一期专题系列，邀请作者提交有关抗菌药物耐药性和微生物组方面的研究成果。
在过去的十年间，大量的研究报道了抗菌药物耐药基因（ARG）的出现和传播，并详细定义了这些基因在病原体以及细菌群落之间的可动性。抗生素对微生物组（特别是人类和动物的微生物组）的影响引起了关注，并可能显著改变生理机能。此外，ARG向这些微生物组的传播已有报道，并且关于污水和废水处理厂的研究明确显示这一现象正在全球范围内发生。在污水中存在抗生素和其他杀菌剂（如洗涤剂）的特定条件下，ARG可能会进一步传播至微生物组，因为其均可能导致微生物多样性发生显著变化。我们需要了解ARG的引入对微生物组的影响，同时，也要考虑AMR扩散到环境中带来的更广泛的问题。
现在，人类微生物组的重要性已经毋庸置疑。在过去的几年中，研究已经揭示了人类微生物组的许多新作用，并且仍在不断探索和构建其与宿主之间代谢相互作用的复杂图景。同样，针对动植物微生物组的研究也提供了令人兴奋的视角，即健康、多样化和稳定的微生物组对可持续农业具有潜在益处。了解ARG在农业和水产养殖等其他食品生产体系中的持续存在和传播，将对食品安全和生产至关重要。我们刚刚开始揭示环境中的微生物组除了在营养循环中发挥重要作用外，其对于生物修复和生物降解也非常重要。由于抗菌药物治疗的高度选择性作用，ARG快速动员，除了传播新的基因组合之外，抗菌药物还可能影响所有这些活动。尽管一些抗生素是天然产物，但其他抗生素则为外源性物质，其会在环境中持续存在，使得移动的ARG作为自然选择的结果继续传播。大多数天然存在的抗药基因具有染色体特性的，需要开展进一步工作来研究这些影响。
微生物群可能通过协同作用降解顽固性化合物。最近的研究表明，环境中出现的抗生素生物降解剂可以减少抗生素的持久性及其在自然界的有害影响。通过了解自然界中产生的抗生素的天然作用，我们可能会找到某些线索，来避免面对新型药物不断增加的耐药性。链霉素产生基因簇仍然存在于土壤链霉菌中，据认为已经存在了数百万年，但其今天依然在自然界中发挥作用。因此，进一步的研究将为新的抗生素给药方法、新的药物类型和对抗耐药性的新方法提供信息。
投稿：您可投稿至参与本期专题征稿的三本期刊中的任何一本，其均属于Microbiome 期刊家族。如果编辑认为您的稿件更适合其他微生物组期刊，将会在同行评审过程中告知作者。每篇稿件都将在合适的期刊进行常规的同行评审，在出版时纳入本专题系列。
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2-year IF: 10.465  

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JCR 分区:MICROBIOLOGY--   SCIE Q1
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  • Microbiome将环境、农业和生物医学领域从事微生物组研究的研究者联合起来的开放获取期刊。
  • 期刊将考虑发表广泛涉及微生物组研究的主题，如微生物调查、生物信息学、元组学方法和群落/宿主相互作用模型等。通过收集并发表这些文献，Microbiome希望能够将微生物生态学各个分支学科中具有共同科学目标的研究人员整合在一起。
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投稿截止日期：2020年7月31日
专题论文导读
Freshwater viral metagenome reveals novel and functional phage-borne antibiotic resistance genes
淡水病毒宏基因组揭示新型功能性噬菌体携带的抗生素耐药基因
DOI: 10.1186/s40168-020-00863-4
Metagenomic analysis reveals the microbiome and resistome in migratory birds
宏基因组分析揭示了候鸟的微生物组和耐药基因组
DOI:10.1186/s40168-019-0781-8
Mobile resistome of human gut and pathogen drives anthropogenic bloom of antibiotic resistance
人体肠道和病原体的移动耐药基因驱动了抗生素耐药性的人为暴发
DOI:10.1186/s40168-019-0774-7
Metagenome of a polluted river reveals a reservoir of metabolic and antibiotic resistance genes
污染河流的宏基因组揭示了代谢和抗生素耐药基因的储存库
DOI:10.1186/s40793-019-0345-3
Identification of discriminatory antibiotic resistance genes among environmental resistomes using extremely randomized tree algorithm
利用极端随机树算法识别环境耐药基因组中的差异化抗生素耐药基因
DOI:10.1186/s40168-019-0735-1
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Antimicrobial resistance and the microbiome
BMC是施普林格∙自然旗下机构。作为开放获取出版先锋，BMC不断推出一系列高质量的同行评议期刊，包括BMC Biology 、BMC Medicine等涵盖范围较广的期刊，以及Malaria Journal、Microbiome和BMC系列期刊等专门刊物。BMC以“科研永不止步”为信条，致力于不断创新，以更好地满足作者群体的需要，确保所发表论文的完整性，并积极推广开放研究。
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