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关键词:COVID-19;石正丽;新冠病毒溯源
石正丽团队刚刚在Nature更新了一篇附录,详细地介绍了她发现蝙蝠冠状病毒RaTG13的全过程

石正丽研究组今年2月Nature最早报道了新型冠状病毒SARS-CoV-2与蝙蝠冠状病毒RaTG13具有96.2%序列同源性
刚刚石正丽组在Nature上传了更新的附录,这则附录报道了该实验室于2012年7月1日至10月1日从昆明医科大学附属第一医院的4名严重呼吸疾病患者中收集了13个血清样本。
这些患者曾赴云南省墨江县通关镇的一个山洞清理蝙蝠粪便,以便开采铜矿。这些患者后于2012年4月26-27日因为肺炎收治入院,医院从6-9月连续采集了这些患者样本。

石正丽研究组对这些样品进行了埃博拉RdRp、尼帕病毒和SARSr-CoV Rp3的PCR检测,以及核衣壳抗体检测,发现这些患者均为阴性。随后该研究组对这一山洞动物如蝙蝠、大鼠、鼬的样本进行检测,
在这些动物或其排泄物内发现了alpha-冠状病毒(非beta-冠状病毒)和副粘病毒。

在随后的2012年至2015年之间,该研究组每年在这个洞穴中采样1-2次,共收集了1322个动物样本,检测出293种高度多样性的冠状病毒。
根据这些病毒RNA聚合酶的测序结果,研究人员发现其中284种为alpha-冠状病毒,9种为beta-冠状病毒这9种beta-冠状病毒均为SARS-CoV家族病毒,但并非感染人类的人类SARS-CoV(RdRp序列差异极大),而是仅感染蝙蝠的SARSr-CoV
其中样品ID4991,被命名为Ra-TG-13(Ra表示蝙蝠来源,TG表示通关镇,13表示发现于2013年)。这个病毒序列在2016年上传至GenBank,ID为KP876546。2018年该组对RaTG13进行了病毒基因组测序。
2020年,在SARS-CoV-2发现后,该组对这一病毒与RaTG13进行了序列比对,发现两者序列同源性为96.2%。

最近该研究组对这些样品进行了SARS-CoV-2核衣壳(与蝙蝠SARSr-CoV具有90%以上氨基酸序列同源性)的
抗体检测,这些患者样品为阴性提示这些患者没有感染SARS-CoV-2,也很可能没有感染过蝙蝠的SARSr-CoV。
资料来源:
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2951-z

编辑:Henry。
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