TGen 正在进行 COVID-19 测试

自1月中旬以来，希望之城下属的TGen（Translational Genomics Research Institute，转化基因组学研究所）一直在针对由 SARS-CoV-2 病毒所引起的 COVID-19 传染病进行检测。作为该病毒基因组的首批研究者，总部位于亚利桑那州的 TGen 正在利用其最先进的生物医学技术来研究这种病毒，同时它还致力于帮助相关部门建立全州范围内的 COVID-19 追踪网络。

3月初，在获得美国食品药品监督管理局（FDA）授予的基因组检测紧急使用授权（EUA）后，TGen 开始与联邦、各州、县、社区政府、私人医疗机构和其他机构进行合作，扩大亚利桑那州的 COVID-19 检测工作，以共同努力来克服这种对全球健康带来威胁的病毒。

TGen 的测试需要使用 RNA 分析来确定病毒是否存在，如出现阳性反应，TGen 的科学家将对患者进行基因组测序工作以确定特定的菌株、来源、移动和变异方式。

“实际上，美国疾病控制中心（CDC）和世界各国都在进行这些类型的测试，用来检测人们的呼吸道样本，也就是人们常说的鼻咽拭子检测。”TGen 病原微生物学研究部（Pathogen and Microbiome Division）联合主任 David Engelthaler 博士对此表示。“如果患者体内存在病毒，我们通常就可以从他的样本类型中检测出来，TGen 的测试可以准确的确定病毒是否存在于该样本中。”

鼻咽拭子检测示意图

每天可处理数百个样本

“实际上，我们可以用拭子来提取受检测人员的遗传物质——采集过程大约需要半个小时到一个小时——然后我们把样本放入聚合酶链式反应机中，大约45分钟便可得知检测结果。整个过程下来不到一个半小时。”虽然针对个人的检测时间并不算长，但是由于 TGen 每次需要测试多达上百个样本，因此整个实验室都在 24 小时通宵工作。他表示，截止到4月中旬，经临床实验室改进修正案（CLIA）认证的 TGen 实验室已经可以每天处理 600 个样本。

TGen 还对来自包括美洲原住民社区等特定社区的 COVID-19 疑似患者和出现症状的个体进行样本分析，并针对特殊群体如长期保健中心和监狱在押人员提供支持，为这些在疫情期间容易被忽视的群体提供帮助。

通过与希望之城医师、医学肿瘤学和治疗学系（Department of Medical Oncology & Therapeutics Research）助理临床教授Laura Goetz博士的合作，TGen 还为希望之城审查委员会提供了一份协议，希望能够为一线高风险医务人员提供全面测试。

“我们试图在病毒造成严重危害前发现它的存在，以便我们更好地了解它们的分布并有针对性的利用公共卫生资源。我们已经具备了高通量的实验室能力，使得我们可以扩大检测规模。现在，我们每天可以处理数百个样本，但是随着相关需求的提升，我们可以在很短的时间内开始每天处理数千枚样本。”Engelthaler 博士表示。

最终，TGen 的信息学团队和希望之城等多个医疗机构进行合作，使用数百名受感染患者的样本进行 SARs-CoV-2 的全基因组序列研究。目前为止，亚利桑那州的所有阳性患者已经超过 600 名，他们的样本都将提供给 TGen 进行病毒基因组测序。

“TGen 的强大之处在于‘用基因说话’，对基因组学进行研究。我们可以找到病毒株的来源，它们在社区中的传播方式，哪些病毒株和其他病毒株之间关联更大，观察和了解这种新的病原体在我们面前的演化过程，并对其进行更进一步的了解。”

这种方法具有许多优势，可以通过确定 COVID-19 在亚利桑那州内外的传播程度，以确定新出现的热点，协助控制和预防该疾病，从而使得整个医疗保险系统受益。