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随着夏季的到来,侵袭人类的新冠肺炎病毒是否会随着高温天气到来而消失?对此,科学界尚没有明确结论。但是已有多位科学家预测,今年秋冬,新冠肺炎很有可能迎来第二波大流行。
早在今年1月,中国就公开分享首个新型冠状病毒全基因组序列,以便公共卫生机构、实验室和研究人员能够访问研究。目前,科学家们已经对来自世界各地的大约32000个病毒基因组进行了测序和共享。大数据的汇聚使得研究人员能够追踪新冠肺炎病毒爆发与传播。研究人员认为,基因组学在疫情防控中,有助缩短疫情的进程。
今年1月,新型冠状病毒在显微镜下的图片被公开
随着疫情在世界各地的传播,病毒在不同地区发生突变,开始形成不同的谱系。今年3月,北京大学生命科学学院及蛋白质与植物基因研究国家重点实验室陆剑课题组和中国科学院上海巴斯德研究所崔杰课题组联合发表文章,提出了新冠病毒存在两个主要谱系——“L”谱系和“S”谱系。此外,曾有英国媒体曝出,在美国北加州传播的新冠病毒,至少有8个谱系。而通过比较基因组序列,研究人员可以快速确定病毒的传输路线。
这对于国际旅行中疫情的判断尤为重要。当各国因疫情经历了一段时间的封锁,并重新开放后,如果出现新的感染病例,从病毒的基因组变异就可以判断病毒的来源。
此外,基因序列数据还能帮助确认感染病毒的医护人员,究竟是在社交活动中感染的,还是通过医院病人感染的。墨尔本生物信息学专家Torsten Seemann表示,如果没有基因组学提供数据,就只通过访问追溯来查找病源,这样的问题通常难以搞清。他认为,基因组数据信息可以大大减轻医疗机构内疫情爆发的调查压力。
同时,基因组数据还能让政府在病毒大流行开始之前“抢先一步”做出预判,从而采取相应应对举措。当然,这种方式也有一定局限性。基因组监测目前仍依赖于广泛的核酸检测来捕获相应序列。而有些无症状感染者不会主动去接受病毒核酸检测。当漏检的情况发生时,这种监测方式可能会出现漏洞。
参考文献:
https://www.nature.com/articles/d41586-020-01573-5
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